Projet H2020 PIGS : Programme mondial innovant de prévention contre Streptococcus suis.

Presque tous les élevages porcins du monde contiennent des souches pathogènes de Streptococcus suis, qui peuvent également infecter les humains. Des outils de surveillance et de prévention indispensables sont en cours de développement. Streptococcus suis (S. suis) est un agent pathogène bactérien qui provoque des affections telles que la septicémie aiguë, la méningite, l'endocardite et la pneumonie chez les jeunes porcs. Elle est également fréquemment associée au syndrome respiratoire porcin, l’une des principales causes de mortalité porcine. De plus, comme le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2), qui cause la COVID-19, S. suis est zoonotique, l’un des nombreux agents pathogènes qui peuvent être transmis des animaux aux humains. Le projet PIGSs, financé par l’UE, améliore notre compréhension de la pathogénicité de S. suis, permettant le développement de vaccins essentiels et d’outils de surveillance. Streptococcus suis et l'énigme des antibiotiques Les épidémies d'infection par S. suis pathogène sont très fréquentes. Des études sur les porcs ont montré qu’entre 3,3 % et 4 % des animaux des fermes européennes touchées étaient atteints de la maladie invasive à S. suis. Cela coûte des millions à l’industrie, sans parler des coûts économiques liés aux maladies humaines. Une étude récente menée en Asie du Sud-Est, où les cas sont les plus nombreux, a révélé que les coûts économiques des maladies humaines s’élèvent à des millions d’euros par an en raison des coûts directs et indirects des soins de santé et de la perte de productivité. A ce jour, il n’existe pas de vaccin de protection croisée autorisé en Europe. Selon Jerry Wells, coordinateur de projet à l'Université et centre de recherche de Wageningen aux Pays-Bas, « le manque de méthodes de surveillance et de vaccins efficaces a conduit à une prévention inadéquate et à une dépendance mondiale à l'utilisation généralisée d'antibiotiques.

Cela conduit à une résistance accrue aux antibiotiques, qui peut se propager à d’autres agents pathogènes qui infectent les animaux et les humains, et à une augmentation de la présence d’antibiotiques dans les aliments destinés à la consommation humaine. Exploiter la réaction en chaîne par polymérase et les outils bioinformatiques Démêler les mécanismes de la maladie à S. suis est un défi. Seul un sous-ensemble de souches est associé à des maladies qui provoquent une morbidité et une mortalité graves. En utilisant une collection mondiale d’environ 2 000 souches non pathogènes et pathogènes, PIGS a identifié des gènes hautement conservés dans les souches pathogènes mais absents dans les autres.

Ces marqueurs ont été utilisés pour développer des tests de réaction en chaîne par polymérase quantitative (PCR) qui amplifient rapidement de petits fragments d’ADN en millions de copies. « Les tests PCR peuvent être utilisés pour la surveillance des isolats d'agents pathogènes dans les élevages », explique Wells. Cela permettra également de cibler les stratégies de prévention et de traitement, par exemple pour les truies qui transmettent des souches pathogènes à leur progéniture. Enfin, l'équipe a utilisé des outils bioinformatiques pour détecter les antigènes conservés (séquences protéiques conservées dans toutes les souches pathogènes de S. suis) et induire des réponses anticorps protectrices chez les porcs. L'équipe évalue actuellement la meilleure façon d'améliorer cette réponse et développe des tests pour évaluer la protection induite par ces vaccins lors de futurs essais.

Mécanismes, facteurs de risque et vaccins Le projet PIGS touche peut-être à sa fin, mais on s’attend à ce que beaucoup plus d’informations émergent des expériences et des analyses en cours. L’équipe élucide actuellement les mécanismes de survie ou de transmission des souches pathogènes. De plus, Wells note qu'une vaste étude épidémiologique est toujours en cours, grâce à laquelle nous espérons mieux comprendre les facteurs qui, dans différentes exploitations, augmentent le risque de contracter la maladie à S. suis. Notre essai vaccinal en cours sur les porcelets pourrait être révolutionnaire, révélant de nouvelles stratégies de vaccination pour les jeunes porcelets. Les PIGS ont considérablement amélioré la compréhension des interactions entre l'hôte, l'agent pathogène et l'environnement de S. suis. Cela soutiendra le développement de vaccins et de stratégies de contrôle plus efficaces, ainsi qu'une surveillance à grande échelle dans les exploitations, pour réduire ou éliminer la maladie.