H2020 PIGS Proiektua: Streptococcus suis-ren Prebentzio Programa Berritzailea.
- Mota Proiektua
- Egoera Bete
- Exekuzioa 2017 -2022
- Esleitutako Aurrekontua 4.998.103,75 €
- Eremua Europeo
- Finantza-iturri nagusia H2020
- Proiektuaren webgunea Proyecto PIGSs
Streptococcus suis txerri-gaixotasun endemikoa da, txerri-ekoizpenaren industrian galera ekonomiko handiak eragiten dituena txerri-eskala handian hazten diren herrialde guztietan. Zenbait herrialdetan, S. suis da txerri gazteen heriotza- eta erikortasun-kausa nagusia eta prebentzio-neurri gisa aminopenizilinaren antibiotikoak agintzeko arrazoirik ohikoena. S. suis ere gizakien patogeno zoonotikoa da, eta mundu osoan jakinarazitako infekzioak nabarmen hazi dira azken urteotan. S. suis-ren barruan mota askotarikoak dira (serotipoak, genotipoak, patotipoak) eta mota guztietako kontrol-estrategien garapenean arazoak sortzen dituztenak. Txerri helduetan garraiatze asintomatikoa ohikoa da eta, ostalariaren-patogenoaren eta ingurunearen arteko elkarrekintzei buruzko ezagutza faltarekin batera, patogeno honen izaera endemikoa kontrolatu ez izanaren arrazoi nagusia da.
Proiektuaren emaitzek S. suis infekzioetan ostalari-patogeno-inguruneko elkarrekintzak ulertzean eragina izango dute, txerri ekoizten diren herrialde nagusietako eremu geografiko adierazgarrietako 1200-1500 S. suis isolatuen genoma sekuentziatuz eta gaixotasun inbaditzailearekin eta garraiatze asintomatikoarekin genoma osoko elkarte-azterketak eginez. Infekzio-arriskuaren monitorizazio globalerako diagnostiko-metodo berriak garatu eta probatuko dira azterketa-ustiategietan. Azterketa epidemiologikoek S. suis gaixotasun inbaditzailearen arrisku-faktoreak zehaztuko dituzte, koinfekzioen eginkizuna barne, eta lehen aldiz gaixotasunaren dinamika egoki ebaluatuko dute ustiategi adierazgarri batean. Patogenian parte hartzen duten birulentzia-mekanismoen ulermena areagotuko dugu, S. suis-ek berezko sistema immunologikoarekin dituen elkarrekintzak barne. Proiektuaren emaitzek prebentzio- eta kontrol-estrategien ebidentzia-oinarria sendotuko dute txerrietan kontserbatutako txerto-antigeno berriak eta mikrobiotaren manipulazioan eta berezko sistema immunearen estimulazioan eta heltzean oinarritutako prebentzio-estrategiak probatuz.
PIGSs proiektuaren helburu nagusia txerrien S. suis infekzioetan ostalari-patogeno-inguruneko elkarrekintzak ulertzea da, eta horrela berrikuntza berrietarako eta prebentziorako eta kontrolerako estrategia eraginkorretarako ebidentzia oinarria sendotzea da. Helburu orokor hau (goian) proiektuak irauten duen bitartean gauzatuko diren helburu zehatz hauetan banatzen da:
- 1. helburua S. suis patogeniaren ulermena areagotzea da, partzialki karakterizatutako edo ezaugarritu gabeko birulentzia-faktoreek patogenian (WP1 eta WP2-ek estalita) duten papera ezaugarrituz.
- 2. helburua S. suis gaixotasun inbaditzailea izateko arriskua murrizteko eta hesteetako fisiologiari laguntzeko mikrobio-soluzioak aurkitzea da, txerriaren berezko immunitate-sistemarekin mikrobiotaren elkarreragina aztertuz, eta S. suis-ren antagonismoa in vivo komentsal espezifikoen bidez (WP3-k estalita).
- 3. helburua da S. suis-rekin gripearen eta txerriaren ugalketa- eta arnas-sindromearen (PRRSV) batera-infekzioak gaixotasuna eta esku-hartzearen porrota (WP4-k estalita) nola eragiten duen argitzea.
- 4. helburua da S. suis anduiaren birulentziaz gain S. suis-k eragindako gaixotasun klinikoaren garapenean parte hartzen duten arrisku-faktore nagusiak zehaztea eta gaixotasunak txerrikumeengan duen eragina zehaztea (WP5-ek estalita).
- 5. helburua (1) S. suis-ren gaixotasunak eragiten dituzten anduiak identifikatzeko diagnostiko-metodo berriak identifikatzea eta garatzea da, eta (2) S. suis-ren hazkundea galarazten duten prebentzio-estrategiak (WP3 eta WP6-ek estalita).
- 6. helburua PIGS proiektuaren emaitzen eragin iraunkorra sustatzea eta zientifikoki alfabetatuagoa den gizarteari laguntzea da PIGSen ikerketa eta berrikuntzen konpromiso publikoaren bidez eta beren komunitatetik haratago (WP8-k estalita).
Proiektuaren emaitzek S. suis infekzioetan ostalari-patogeno-inguruneko elkarrekintzak ulertzean eragina izango dute, txerri ekoizten duten herrialde nagusietako eremu geografiko adierazgarrietako S. suis isolatuen bilduma handi bat sekuentziatuz eta gaixotasun inbaditzailearekin eta garraiatze asintomatikoarekin genoma osoko elkartze-azterketak eginez. Diagnostiko-metodo berriak garatu dira infekzio-arriskuaren monitorizazio globala egiteko eta azterketa-ustiategietan probatu dira. Azterketa epidemiologikoek S. suis gaixotasun inbaditzailearen arrisku-faktoreak zehaztu dituzte, koinfekzioen eginkizuna barne, eta lehen aldiz gaixotasunen dinamika behar bezala ebaluatu dute ustiategi adierazgarri batean. Patogenian parte hartzen duten birulentzia-mekanismoen ulermena ere hobetu dugu, S. suis-ek berezko sistema immunologikoarekin dituen elkarrekintzak barne.
Proiektuaren emaitzek prebentzio eta kontrol estrategien ebidentzia oinarria sendotu dute txerrietan kontserbatutako txerto-antigeno berriak probatu eta mikrobiotaren manipulazioan eta berezko sistema immunearen estimulazioan eta heltzean oinarritutako prebentzio-estrategiak ezarriz. Proiektuaren 3. aldian, lan-pakete guztiek jarraitu zuten eta zeregin guztiak amaitu ziren, COVID-19 pandemiak eragindako atzerapen handiak egon arren.
PIGS-ek (Streptococcus suis Global Berritzaileen Prebentziorako Programa) jorratzen dituen gaiak txerri-ekoizpenaren industria globalak jasaten dituen galera ekonomiko handiak eta Streptococcus suis bakterioaren infekzioek eragindako animalien osasunean eragiten duten zama dira. Patogeno honek txerriengan gaixotasun inbaditzaileak sor ditzake, sepsi akutua, meningitisa, endokarditisa, pneumonia eta artritisa bezalako sintomak sarritan jakinaraziz. Mundu osoko txerri-haztegien ia % 100ek animalia eramaileak dituzte. S. suis-k txerriengan gaixotasuna eragiten duen ala ez faktore patogenoen, ostalari-faktoreen, ingurumen-faktoreen eta haien elkarrekintzen araberakoa da. Mikrobio-patogenoaren osaera genetikoaren araberakoa da, baita ostalariaren suszeptibilitatearen araberakoa ere, koinfekzioa, adina, immunitatea, mikrobiota... Gainera, ingurumen-faktoreek, hala nola estresa eta higiene-faktoreak, elkarrekintzan eragina izan dezakete ostalariaren, mikrobiota edo bide-egoera neutro edo birulgenoaren "portaera" aldatuz.
Ezagutza hori txertaketaren bidez gaixotasunen prebentzioan berrikuntzak garatzeko erabiliko da, S. suis kolonizazioaren aurkako erresistentzia sustatzeko eta txerrikume gazteen berezko immunitatea suspertzeko. Gainera, sortutako ezagutzak andui patogenoen diagnostiko-markatzaileen garapena ekarriko du, lehen aldiz ustiategietako infekzioen dinamika aztertzeko eta abeltzaintzako praktiketan arrisku-faktoreak identifikatzea, baita gaixotasun-agerraldiak prebenitzeko edo kontrolatzeko estrategiak ere. PIGSs proiektuaren helburu nagusi bat txerrien S. suis infekzioetan ostalari-patogeno-inguruneko elkarrekintzen ulermena sakontzea da, eta horrela berrikuntza berrietarako eta prebentzio- eta kontrol-estrategi eraginkorretarako ebidentzia-oinarria sendotzea da.
Streptococcus suis txerri-gaixotasun endemikoa da, eta txerri-ekoizpenaren industriari galera ekonomiko handiak eragiten dizkio txerri-eskala handian hazten diren herrialde guztietan. Zenbait herrialdetan, S. suis da txerri gazteen heriotza- eta erikortasun-kausa nagusia eta prebentzio-neurri gisa aminopenizilinaren antibiotikoak agintzeko arrazoirik ohikoena. S. suis ere gizakien patogeno zoonotikoa da, eta mundu osoan jakinarazitako infekzioak nabarmen hazi dira azken urteotan. S. suis-ren barruan mota askotarikoak dira (serotipoak, genotipoak, patotipoak) eta mota guztietako kontrol-estrategien garapenean arazoak sortzen dituztenak.
Txerri helduetan garraiatze asintomatikoa ohikoa da eta, ostalariaren-patogenoaren eta ingurunearen arteko elkarrekintzei buruzko ezagutza faltarekin batera, patogeno honen izaera endemikoa kontrolatu gabe gelditzearen arrazoi nagusia da. Proiektuaren emaitzek S. suis infekzioetan ostalari-patogeno-inguruneko elkarrekintzak ulertzean eragina izango dute txerri ekoizten diren herrialde nagusietako eremu geografiko adierazgarrietako 1200-1500 S. suis isolatuen genomaren sekuentziazioaren bidez eta gaixotasun inbaditzailearekin eta garraiatze asintomatikoarekin genoma osoko asoziazio-azterketak.
Diagnostiko-metodo berriak garatuko dira infekzio-arriskuaren monitorizazio globala egiteko eta kasu-ustiategietan probatuko dira. Azterketa epidemiologikoek S. suis gaixotasun inbaditzailearen arrisku-faktoreak zehaztuko dituzte, koinfekzioen eginkizuna barne, eta lehen aldiz gaixotasunen dinamika egoki ebaluatuko dute ustiategi adierazgarri batean. Patogenian parte hartzen duten birulentzia-mekanismoen ulermena areagotuko dugu, S. suis-ek berezko sistema immunologikoarekin dituen elkarrekintzak barne. Proiektuaren emaitzek prebentzio- eta kontrol-estrategien oinarri enpirikoak sendotuko dituzte txerrietan kontserbatutako txerto-antigeno berrien probaren bidez eta mikrobiotaren manipulazioan eta berezko sistema immunearen estimulazioan eta heltzean oinarritutako prebentzio-estrategien bidez.
Munduko txerri-haztegi ia guztiek Streptococcus suis-ren andui patogenoak dituzte, gizakiak ere kutsa ditzakete. Beharrezkoak diren zaintza eta prebentzio tresnak garatzen ari dira. Streptococcus suis (S. suis) txerri gazteetan sepsi akutua, meningitisa, endokarditisa eta pneumonia bezalako baldintzak eragiten dituen bakterio patogeno bat da. Era berean, maiz lotzen da txerriaren arnas sindromearen konplexuarekin, txerrien hilkortasunaren kausa nagusietako bat. Gainera, COVID-19 eragiten duen arnas sindrome akutu larria 2 (SARS-CoV-2) bezala, S. suis zoonotikoa da, animalietatik gizakietara transmititu daitezkeen patogeno askotako bat. EBk finantzatutako PIGSs proiektua S. suis patogenikotasunaren ulermena hobetzen ari da, funtsezko txertoak eta zaintza tresnak garatzea ahalbidetuz. Streptococcus suis eta antibiotikoen enigma S. suis patogenoaren infekzio-agerraldiak oso ohikoak dira. Txerriekin egindako ikerketek erakutsi zuten kaltetutako Europako ustiategietako animalien % 3,3 eta % 4 artean S. suis gaixotasun inbaditzailea zutela. Horrek milioiak kostatzen dizkio industriari, giza gaixotasunen kostu ekonomikoak ahaztu gabe. Asiako hego-ekialdeko azken ikerketa batek, kasurik handienak diren tokian, jakinarazi duenez, giza gaixotasunen kostu ekonomikoak milioi eurokoak dira urtero, osasun-kostu zuzenak eta zeharkakoak eta produktibitatea galdu dutelako. Orain arte, Europan ez dago babes gurutzatuaren txertorik baimendurik. Jerry Wells, Herbehereetako Wageningen Unibertsitateko eta Ikerketako proiektuko koordinatzaileak dioenez, "zaintza metodo eta txerto eraginkorren faltak prebentzio desegokia eta antibiotikoen erabilera hedatu batean konfiantza izatea eragin du.
Horrek antibiotikoen erresistentzia areagotzea dakar, animaliak eta gizakiak kutsatzen dituzten beste patogeno batzuetara hedatu daitekeena, eta gizakiak kontsumitzeko elikagaietan antibiotikoen presentzia areagotzea dakar. Polimerasaren kate-erreakzioa eta tresna bioinformatikoak aprobetxatzea S. suis gaixotasunaren mekanismoak argitzea erronka da. Tentsioen azpimultzo bat baino ez dago eritasun eta hilkortasun larria eragiten duten gaixotasunekin. 2.000 andui ez-patogeno eta patogeno inguruko bilduma global bat erabiliz, PIGS-ek andui patogenoetan oso kontserbatuta zeuden baina gainerakoetan ez zeuden geneak identifikatu zituen.
Markatzaile hauek DNA zati txikiak milioika kopiatan azkar handitzen dituzten polimerasaren kate-erreakzio kuantitatiboa (PCR) entseguak garatzeko erabili ziren. PCR entseguak ustiategietako patogeno isolatuen zaintzarako erabil daitezke", azaldu du Wells-ek. Horrek prebentzio eta tratamendu zuzendutako estrategiak ere ahalbidetuko ditu, adibidez, beren ondorengoei andui patogenoak transmititzen dizkieten berientzat. Azkenik, taldeak tresna bioinformatikoak erabili zituen kontserbatutako antigenoak (proteina-sekuentziak kontserbatutako antigenoak (protein-sekuentziak kontserbatutakoak) eta S. Erantzun hori hobetzeko modurik onena aztertzen ari da taldea, eta etorkizuneko entseguetan txertoek eragindako babesa ebaluatzeko saiakuntzak garatzen ari da.
Mekanismoak, arrisku-faktoreak eta txertoak Baliteke PIGS proiektua amaitzear egotea, baina abian diren esperimentu eta analisietatik askoz informazio gehiago aterako dela espero da. Taldea andui patogenoen biziraupen edo transmisio mekanismoak argitzen ari da. Horrez gain, Wells-ek adierazi duenez, "azterketa epidemiologiko handi bat abian da oraindik, eta hortik aurrera S. suis gaixotasuna hartzeko arriskua areagotzen duten hainbat ustiategietako faktoreak gehiago ezagutzea espero dugu. Txerrikumeekin egiten ari den gure txertoaren proba iraultzailea izan daiteke, txerrikume gazteentzako txertaketa-estrategia berriak agerian utziz. TXERRIK-ek asko hobetu du S. suis-en garapenaren eta ingurunearen garapenaren euskarri hauen arteko elkarrekintzak ulertzea. txerto eta kontrol-estrategi eraginkorragoak, baita ustiategiko zaintza eskala handikoak ere, gaixotasuna murrizteko edo ezabatzeko.
Txerri-taldeetan S. suis-ren kontrola, oro har, serotipo eta andui askoren aurka babesten duten txertoen faltak oztopatzen du. Anduien artean, serotipoen artean eta haien barnean dagoen aldakortasun genotipiko, fenotipiko eta geografiko handia dela eta. Gure asmoetako bat babes gurutzatuko proteina azpiunitateen txerto global bat garatzea da GWAS erabiliz, patogeno isolatuetan kontserbatutako antigeno hautagaiak hautatzeko. Ikuspegi berritzaile hau, GWAS eta alderantzizko txertoenologia konbinatuz, mundu osoko txerri-ekoizleen eskualde nagusietako isolamendu-bilduma handi bat sekuentziatzeko gure anbizioari esker bakarrik izango da posible.
Bigarren asmoa GWAS-en oinarritutako S. suis andui patogenoen diagnostikoan berrikuntzak garatzea da. Jatorrizko ideia honek andui birulente patogenoak eta andui ez birulenteak bereizteko ezintasuna gaindituko du. Arazo horri aurre egiteak aukera emango du, lehen aldiz, antibiotikoen metafilaxia bideratzeko diagnostikoak eta S. suis agerraldiak kontrolatzeko txertoa erabiltzeko.
Horrek eraginkortasuna areagotzen du eta txerri-hazkuntzan antibiotikoen erabilera murrizten laguntzen du. Epe luzera, PIGSs proiektuak txerrietan S. suis gaixotasuna nabarmen murrizten laguntzea espero du eta, ondorioz, animalien osasuna eta ongizatea.
- WAGENINGEN UNIVERSITY (WU)
Lotutako proiektuak
