Projet H2020 BreedingValue : Stratégies de pré-sélection pour l'obtention de nouvelles baies résilientes et à valeur ajoutée

La deuxième phase de BreedingValue a été consacrée à la capture et à la caractérisation de la diversité génétique dans GenRes et de sa valeur, révélant de nouvelles perspectives pour les éleveurs, les producteurs et les consommateurs. La nomenclature des matériaux pour les trois espèces, qui contient l'utilisation constamment mise à jour du matériel génétique dans les différentes tâches de chaque lot de travail, a servi de base fiable pour toutes les activités de la conception expérimentale et les données attendues (lot de travail 1). Des essais sur le terrain ont été planifiés et configurés spécifiquement pour chaque tâche dans différentes conditions de croissance, et des données ont été collectées pour 2022 et 2023. Les essais expérimentaux ont été configurés pour analyser les performances agronomiques en réponse à différents stress des matériaux de pré-sélection générés par le projet, et les données collectées en 2022 et 2023 ont été utilisées pour mesurer l'augmentation de la durabilité grâce à l'ACV. Concernant le génotypage (Work Package 2), tous les champs expérimentaux ont été établis. Les différents bénéficiaires sont à différents stades de récupération des données de terrain : certains ont terminé la collecte d’échantillons, tandis que d’autres partenaires prévoient de collecter des échantillons dès la saison 2024.

Tous les échantillons collectés ont été transférés au laboratoire de génomique, qui a effectué les analyses. La plupart des entreprises ont terminé leur génotypage, tandis que d’autres seront également actives dans la période à venir. Des données phénotypiques ont également été collectées pour l’identification des gènes/marqueurs et une prédiction génomique est en cours de génération. Les responsables du projet, en collaboration avec divers partenaires, ont déjà commencé à analyser les données génomiques générées. À la suite des appels spécifiques, cinq entreprises ont été incluses pour la validation du MAS dans les fraises et les framboises ; deux pour des études de sélection génomique. Concernant le phénotypage (WP3), la mise en œuvre des POE harmonisés précédemment développés pour différents paramètres liés à la qualité des fruits et à l'analyse sensorielle a été suivie.

Des méthodes de criblage rapide, telles que la spectroscopie NIR et l'imagerie 3D chez les fraises, et l'imagerie hyperspectrale chez les plants de framboises et de bleuets, ont été utilisées pour construire des modèles de prédiction de la qualité des fruits (pour l'imagerie NIR et 3D) et de la résilience et du rendement des plantes (pour l'imagerie hyperspectrale). Un logiciel a été développé pour visualiser l'architecture végétale en représentations 2D et 3D et pour analyser son développement. Des études post-récolte ont été appliquées aux trois espèces. Afin de produire des outils d'analyse sensorielle harmonisés (WP4) au niveau européen, le développement de lexiques multilingues (7 langues) pour les baies a été achevé, afin de fournir des descriptions de la qualité des fruits. Des recherches ont été menées pour valider la pertinence et l’efficacité des lexiques à l’aide de panels formés. Des tests de panel ont été réalisés en utilisant les lexiques développés. Afin de communiquer avec les acteurs du secteur des fruits frais, deux ateliers régionaux (Espagne/Royaume-Uni) ont été organisés.

Les données collectées par la méthodologie Future Workshop utilisée ont été combinées avec des données précédemment collectées par des consultations d’experts. Le contact avec les acteurs de la chaîne d’approvisionnement en fruits et les consommateurs a été réalisé au moyen d’enquêtes en ligne pour recueillir les commentaires des consommateurs sur la qualité des baies. Les données ont montré des contours communs clairs entre les choix de baies perçus en termes de qualité, sensoriels, hédoniques, économiques et culturels, et des différences pertinentes sont apparues entre les perspectives des parties prenantes et les préférences des consommateurs, vérifiées par une analyse statistique. Afin de garantir la méthodologie standardisée d'organisation des tests sensoriels auprès des consommateurs de chaque espèce de baies, des lignes directrices et des questionnaires ont été créés et des événements de tests auprès des consommateurs ont été organisés.

La méthodologie a été communiquée aux entités de sélection dans le cadre de l'appel ciblé 4. Les travaux sur une méthodologie de visualisation harmonisée de la qualité sensorielle des fruits en sont encore à leurs débuts. Les premiers ensembles de données sensorielles collectées ont été présentés sous forme de profils sensoriels et analysés à l'aide de tests statistiques pour valider les lexiques de test du panel. La gestion des données est considérée comme une priorité pour BreedingValue, c'est pourquoi le WP5 a été suivi, en étroite collaboration avec tous les WP, pour établir les nomenclatures et définir les méthodologies de collecte d'échantillons et d'enregistrement des données. La plateforme Germina a été adoptée pour faciliter ce processus. Il était essentiel d’importer et d’intégrer les ensembles de données précédents, en commençant par les données historiques fournies par différents partenaires. Tous les partenaires se sont mis d’accord sur le niveau de confidentialité qui serait appliqué en fonction du type de données.

La visualisation des données pour l'exploration et l'analyse de GenRes dans une interaction conviviale pour le consommateur et la communauté a été facilitée grâce à de nouveaux outils de documentation et de communication. Tous les partenaires de BreedingValue ont activement diffusé le projet et ses résultats (WP6), atteignant un large public. Diffusion lors de conférences internationales (ex. : IHC2022-FR, ISHS Rubus Ribes Symposium 2023-USA, PAG31-USA) et participation à différentes conférences scientifiques nationales. Les partenaires de BreedingValue ont déjà publié 17 articles évalués par des pairs. Plusieurs ateliers de projet ont été organisés, dont un atelier sur la propriété intellectuelle des ressources génétiques (GenRes) en 2023. Des activités de démonstration sur le terrain ont été mises en œuvre et des ateliers ont été organisés avec des producteurs et des sélectionneurs. Afin de former les jeunes étudiants et chercheurs de tous niveaux aux technologies et connaissances développées par BreedingValue, trois écoles de fruits rouges ont été organisées en 2023. Le site Web du projet continue de fournir des informations sur le projet et ses activités, et les médias sociaux (X et LinkedIn) offrent une visibilité au grand public. Toutes les activités sont coordonnées et supervisées par le Comité de pilotage, qui se réunit mensuellement (WP7).