Projecte H2020 NEWCOTIANA: Desenvolupament de cultius multipropòsit de Nicotiana per a l'agricultura molecular mitjançant noves tècniques de fitomillorament
- Tipus Projecte
- Estat Completat
- Execució 2018 -2022
- Pressupost assignat 7.363.310,00 €
- Àmbit Europeo
- Comunitat Autònoma Comunitat Valenciana; Extremadura; Madrid, Comunidad de
- Font principal de finançament Horitzó 2020
- Web del projecte https://doi.org/10.3030/760331
NEWCOTIANA ha avançat més enllà de l'estat de l'art en tecnologies de nucleasa específica de seqüència (SSN) i optimització de plataformes. Hem desenvolupat alternatives nucleases i mètodes més eficients d'edició de gens.
Per a l'optimització de la plataforma, el nou assemblatge del genoma de N. benthamiana ha establert una fita crucial a les biofàbriques de plantes que facilitarà futures estratègies de millora.
La col·lecció ampliada d'elements reguladors representa un avenç crucial en l'aplicació de la intragènesi a la cria.
S'han obtingut i validat prototips de línies Nicotiana que incorporen nous i valuosos trets de biofactoria a escala de laboratori i en camp obert.
A continuació, aquests són breument els principals impactes derivats de Newcotiana:
- Científic: el projecte ha desenvolupat nous recursos per a les NBTs. S'ha aprofundit en la comprensió de la funció gènica a les espècies de Nicotiana i les interaccions entre el metaboloma i el comportament agronòmic.
- Tècnica: s'han generat noves línies de prototips utilitzant NBTs i validades a escala pilot, fet que ha portat a la selecció de varietats vegetals d'elit com a biofàbriques. Aquestes línies elit mostren una millor producció de proteïnes recombinants (major qualitat i/o rendiment) o metabòlits de valor afegit. S'han establert cascades de biorefineries per a l'ús complet de les biofàbriques de tabac, complint els requisits de l'economia circular.
- Social: A la UE, al voltant de 60.000 productors de tabac i d'altres llocs de treball indirectes es veuen amenaçats per la disminució de la demanda de tabac. NEWCOTIANA brindarà l'oportunitat de mantenir aquests llocs de treball i generar-ne de nous, revitalitzant les zones rurals on el tabac és un cultiu tradicional, així com els nous que incorporaran a NEWCOTIANA.
L'escalabilitat de la biofàbrica de NEWCOTIANA millorarà l'accessibilitat als productes biofarmacèutics (vacunes, anticossos i altres) la disponibilitat dels quals està en risc degut als alts costos de fabricació i/o als llargs cicles de producció. A més, NEWCOTIANA té com a objectiu proporcionar a la indústria, als responsables polítics i als consumidors proves experimentals que facilitin el procés de presa de decisions per a l'adopció de NBT.
Els científics de Newcotiana van poder crear plantes que produeixen productes biològics de manera més eficient i amb millor qualitat, com a factors de creixement humà (hGF) involucrats en la regeneració cel·lular o anticossos secretors humans utilitzats per combatre patògens de la mucosa. Paral·lelament, els investigadors van aconseguir enriquir la composició de les plantes de tabac en petites molècules d'alt valor afegit, com l'anatabina i l'esqualè, amb aplicacions en biomedicina com a potencial antiinflamatori i adjuvant de vacunes.
Un dels resultats principals del projecte va ser la realització de tres rondes d'assajos a camp obert (2020-2022) per estudiar el comportament agronòmic de les noves varietats de tabac. Els resultats dels assajos van ser encoratjadors i els trets observats a l'hivernacle es van confirmar al camp. Les línies enriquides cultivades al camp es van sotmetre a un procés de biorefineria optimitzat on, a més d'anatabina i esqualè, es van aïllar altres productes químics d'alt valor de la biomassa de tabac, deixant les restes per a la producció de biogàs.
Altres resultats importants inclouen (i) la generació d'un recurs multiòmic per a N. benthamiana que inclou assemblatges de genomes d'alta qualitat de dos ecotips, anotacions genètiques actualitzades, paisatges epigenòmics i de transposons; ii) desenvolupament de noves eines per a les NBT, incloses enzims CRISPR més eficients, mètodes alternatius per a l'administració d'ARNg, mètodes optimitzats per a la selecció de gens i nous elements intragènics; (iii) generació de línies de tabac biofactorials i no de floració amb millors perfils de qualitat i innocuïtat i augment de la biomassa. S'han creat dotzenes de línies de plantes pròpies, dues de les quals estan destinades a ser registrades, mentre que s'està presentant una patent que en cobreix diverses altres.
S'han generat models tecnoeconòmics per a productes proteics (hGFs, vacunes VLP i anticossos) i metabòlits (anatabina i esqualè) i s'han explorat escenaris de producció combinats que mostren la potencial viabilitat financera d'alguns dels productes. S'ha fundat una empresa spin-off per tal d'explotar la propietat intel·lectual derivada del projecte. Hi ha hagut interaccions constants amb les parts interessades, inclosos els responsables de la formulació de polítiques, les associacions de pagesos i la indústria, i el públic en general. S'han dut a terme més de 200 activitats de difusió i comunicació, com ara conferències, tallers, 38 publicacions científiques (zenodo.org/communities/newcotiana), exposicions i vídeos (newcotiana.org/videos). S'han fet informes sobre les opinions de les parts interessades i la percepció pública dels NBT.
NEWCOTIANA és un projecte de recerca que utilitza Noves Tècniques de Millora (NBTs) per desenvolupar noves varietats de plantes de Nicotiana que produeixen productes químics de valor final. Les plantes es poden utilitzar com a biofàbriques de productes biofarmacèutics i altres productes químics de valor afegit a escala agrícola, oferint una solució sostenible per a les necessitats de fabricació presents i futures. Les espècies del gènere Nicotiana, més específicament N. tabacum (tabac cultivat) i N. benthamiana (un parent australià), es troben entre les biofàbriques de plantes més utilitzades a causa dels seus atributs favorables, com la versatilitat metabòlica, la facilitat de cultiu, l'alt rendiment, la disponibilitat d'eines genètiques per a la de contaminació del subministrament daliments.
En contrast amb la seva alta apreciació com a biofàbrica, el cultiu tradicional de tabac està en continu declivi a Europa a causa, entre altres raons, de la mala reputació d'un cultiu que s'utilitza principalment per a la fabricació de cigarrets i altres productes per fumar. NEWCOTIANA té com a objectiu oferir una alternativa als productors de tabac mitjançant la cria de varietats competitives de biofàbrica de Nicotiana per a productes no fumadors d'alt valor. Tot i això, per convertir-se en biofàbriques totalment competitives i escalables, les plantes de Nicotiana necessiten incorporar trets no convencionals com l'estabilitat de les proteïnes o la fortificació de metabòlits, que no són accessibles per al millorament tradicional.
Recentment, han sorgit NBTs que brinden oportunitats sense precedents per a la biotecnologia vegetal. La hipòtesi rectora de NEWCOTIANA és que l'obtenció de varietats de tabac a biofàbrica per a productes no fumadors d'alt valor és possible amb l'ús de NPBT. A més, els objectius de NEWCOTIANA inclouen millorar la consciència pública i la comprensió de les NBT mitjançant la creació d'un diàleg bidireccional entre la ciència, d'una banda, i les parts interessades, els responsables polítics i el públic en general, de l'altra. Els resultats de NEWCOTIANA demostren el gran potencial de NBT en el desenvolupament de nous cultius, específicament cultius industrials, en resposta als desafiaments socials i agrícoles actuals. Al projecte es van generar noves varietats vegetals de valor afegit amb una composició millorada. Es van fer assajos de camp per avaluar el rendiment agronòmic de les noves varietats. Es van abordar totes les possibles àrees de preocupació plantejades a l'anàlisi d'avaluació de riscos i no van sorgir altres problemes de seguretat dels assajos. Els objectius del projecte van ser percebuts molt positivament per parts interessades i ben rebuts pel públic.
L'opinió pública positiva va ser el resultat dels beneficis socials percebuts derivats del projecte i va ser facilitada per l'estat no alimentari del cultiu. A la llum d'aquests resultats, el consorci NEWCOTIANA considera que és molt necessari aixecar les restriccions actuals basades en la tecnologia a l'NBT, i la seva substitució per una nova regulació cas per cas que se centri en els productes, per respondre a les necessitats dels productors i alhora alinear-se amb la percepció pública actual.
Un grup de Noves Tècniques de Millora de Plantes (NPBT) ha obert oportunitats sense precedents a l'agricultura. Aquestes NPBT són almenys tan eficients i, sovint, més precises que les tècniques tradicionals i de modificació genètica prèvies, alhora que eviten la introducció de transgens hereditaris d'espècies distants al genoma vegetal. Si es comuniquen adequadament, s'espera que les NPBT guanyin una acceptació àmplia, especialment quan s'apliquin a objectius de millora que es considerin beneficiosos per a la societat. Un objectiu ben percebut és l'Agricultura Molecular, que fa referència a l'ús de plantes per a la producció de biomolècules valuoses (per exemple, productes biofarmacèutics).
El tabac cultivat (Nicotiana tabacum) i el seu parent australià proper, Nicotiana benthamiana, són les espècies preferides a l'Agricultura Molecular a causa de les seves característiques favorables: cultius no alimentaris, fàcil regeneració tissular, alta productivitat, ric metabolisme secundari i disponibilitat d'eines genètiques. En marcat contrast, el cultiu tradicional de tabac està en greu declivi a la UE, cosa que causa greus problemes socials a moltes zones rurals.
NEWCOTIANA busca revitalitzar aquestes àrees mitjançant el desenvolupament de biofàbriques eficients de Nicotiana per a productes no fumables d'alt valor com a alternatives als cultius tradicionals de tabac. NEWCOTIANA desenvoluparà el conjunt d'eines més avançades de NPBT de tabac, fàcilment transferible a altres plantes. Això posicionarà la UE a l'avantguarda de la innovació en el millorament. Aquest conjunt d'eines s'utilitzarà per crear varietats de Nicotiana d'elit multipropòsit millorades en característiques específiques del producte (qualitat, estabilitat i rendiment del bioproducte), juntament amb característiques més generals com ara biomassa, resiliència i bioseguretat.
Les varietats "Newcotiana" es provaran acuradament en entorns preindustrials rellevants per a la producció de substàncies químiques de valor final, en concret proteïnes i metabòlits per a ús en la salut i nutracèutic. Se supervisaran de prop els aspectes ètics, socials i legals, i es garantirà la participació del públic i les parts interessades mitjançant metodologies innovadores de comunicació científica.
La biotecnologia vegetal té un paper emergent en la producció de medicaments de molècules petites, productes biològics (vacunes i terapèutics) i reactius de diagnòstic. Ofereix una alternativa escalable i de baix cost a les plataformes de fabricació tradicionals basades en cèl·lules microbianes i animals. A més, pot abordar els desafiaments causats per la distribució i l'emmagatzematge de medicaments, especialment a regions del món amb cadenes de producció incompletes. Noves varietats de plantes de tabac per a la producció de medicaments Les plantes de tabac són molt apreciades com a biofàbriques de plantes a causa del seu potencial com a fonts valuoses de compostos d'alt valor. Tot i això, en estar associat a la fabricació de productes per fumar, el cultiu del tabac està en continu declivi a Europa. El projecte finançat per la UE Newcotiana(S'obre en una finestra nova).
El projecte es va proposar canviar aquesta percepció mitjançant el desenvolupament de varietats competitives de Nicotiana que es puguin utilitzar per a productes no fumadors, creant una plataforma de producció adequada per a la bioeconomia de la UE i aportant sostenibilitat a un cultiu tradicional. El consorci va treballar amb dues espècies de plantes, Nicotiana tabacum, el tabac cultivat normalment, i Nicotiana benthamiana, una mena de tabac silvestre australià. Per aprofitar al màxim el potencial d'aquestes espècies com a biofàbriques, els científics van haver d'incorporar trets específics associats amb l'estabilitat, sostenibilitat i rendiment de compostos d'alt valor. Eines per dissenyar noves característiques de la planta Atès que no era possible generar aquests trets a través dels mètodes tradicionals de millora de cultius, el consorci va desenvolupar eines per facilitar la millora accelerada de biofàbriques de plantes. «Durant segles, hem criat les nostres plantes utilitzant tècniques tradicionals de millora genètica per produir més i millors aliments, o per resistir els patògens, però no per millorar les biofàbriques de medicaments», destaca el coordinador del projecte, Diego Orzáez.
Noves tècniques de millorament, inclosa l'edició del genoma, van millorar les plantes per utilitzar-les en biofàbriques en un temps rècord. Els investigadors van dissenyar plantes de tabac que no floreixen al camp, però estalvien l'energia per augmentar-ne la biomassa. A més, van dissenyar aquestes plantes per evitar la glicosilació no desitjada o per reduir l'activitat de la proteasa, dos trets implicats en la qualitat i la funcionalitat dels productes proteics finals obtinguts de la planta. En diversos casos, les plantes es van modificar per contenir una combinació d'aquests trets especials. Aplicacions de les plantes d'enginyeria En el cas de l'espècie de tabac cultivat N. tabacum, el consorci va enriquir la composició de la planta en compostos de valor agregat amb ús farmacèutic. Un d'aquests compostos va ser escualeno(S'obre en una finestra nova), una substància que actualment s'obté principalment de fonts no sostenibles (taurons) i s'empra com a adjuvant en moltes formulacions de vacunes. Els investigadors també van produir Anatabina(S'obre en una finestra nova), una molècula relacionada amb la nicotina amb efectes antiinflamatoris, que s'està investigant com un possible tractament per a diferents malalties autoimmunes.
L'enginyeria de N. benthamiana va ser lleugerament diferent, ja que aquesta planta ja era utilitzada per la indústria per produir proteïnes recombinants utilitzades en cosmètics i productes farmacèutics. Els socis de Newcotiana van compartir la seqüència del genoma de N. benthamiana per ajudar els equips en el descobriment de nous productes biofarmacèutics. Un procés de biorefineria de residu zero Juntament amb els esforços per millorar el valor de mercat d'aquestes varietats i potser enriquir-les en molècules addicionals d'alta gamma, els investigadors van establir un procediment pilot de biorefineria de zero residus. "L'objectiu és crear un cultiu i una indústria associada que sigui almenys tan rendible com ho era el cultiu de tabac per fumar", emfatitza Orzáez. "Per això, la legislació de la UE ha de ser més flexible i donar suport a l'enginyeria de cultius industrials".
- AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
- IDOASIS 2002 SL
- QUEENSLAND UNIVERSITY OF TECHNOLOGY - QLD QUT
- BIOFACTION KG
- DERMOPARTNERS S.L.
- FRAUNHOFER GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER ANGEWANDTEN FORSCHUNG EV
- ASOCIACION EMPRESARIAL DE INVESTIGACION CENTRO TECNOLOGICO NACIONAL AGROALIMENTARIO EXTREMADURA
- SESDERMA SL
- NATAC BIOTECH SL
- AGENZIA NAZIONALE PER LE NUOVE TECNOLOGIE, L'ENERGIA E LO SVILUPPO ECONOMICO SOSTENIBILE
- JOHN INNES CENTRE
- KARLSRUHER INSTITUT FUER TECHNOLOGIE
- NEUTRAL SUPPLY CHAIN LIMITED
- VIB VZW
- Philip Morris Products S.A.
- UNIVERSITAET FUER BODENKULTUR WIEN
- ST GEORGE'S HOSPITAL MEDICAL SCHOOL
- LEIBNIZ-INSTITUT FUR PFLANZENBIOCHEMIE
- THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
- MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
- ROYAL HOLLOWAY AND BEDFORD NEW COLLEGE
- Fitxa del projecte CORDIS (pdf)
- Col·lecció d'elements intragènics funcionalment caracteritzats
- Informe sobre la percepció pública dels TNPN
- Una caixa d'eines GT universal transferible per a Nicotiana i altres espècies d…
- Llibre blanc sobre l'avaluació dels NPBT per a les pràctiques de cria futures
- Pla de comunicació i pla d'acció de gènere
- Informe Final de Comunicació
- Informe inicial sobre la informació de les parts interessades dels NPBT i lagri…
- Col·lecció d'enzims d'edició amb eficiències comparades i model predictiu
- Informe Final de Difusió
- Informe final sobre les opinions de les parts interessades i els efectes previs…
- Informe Final sobre Actualització de la Regulació i la Bioseguretat
- Informe inicial sobre actualitzacions de la regulació i la bioseguretat
- Pla de difusió
- Desenvolupament d'un navegador de genoma basat a la web Apollo per a l'assembla…
- Allotjament d'eines web, programari dedicat i documentació de peces d'ADN
- Col·lecció de materials de comunicació audiovisual i basats a la web
- PacBio seqüenciació i assemblatge del genoma de N. benthaminana
- Web d'AGÈNCIA ESTATAL CONSELL SUPERIOR D'INVESTIGACIONS CIENTIFIQUES
- Web de QUEENSLAND UNIVERSITY OF TECHNOLOGY - QLD QUT
- Web de BIOFACTION KG
- Web de FRAUNHOFER GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER ANGEWANDTEN FORSCHUNG EV
- Web d'ASSOCIACIÓ EMPRESARIAL D'INVESTIGACIÓ CENTRE TECNOLOGIC NACIONAL AGROALIM…
- Web d'AGENZIA NAZIONALE PER LI NUOVE TECNOLOGIE, L'ENERGIA I EL SVILUPPO ECONOM…
- Web de JOHN INNES CENTRE
- Web de KARLSRUHER INSTITUT FUER TECHNOLOGIE
- Web de VIB VZW
- Web d'UNIVERSITAET FUER BODENKULTUR WIEN
- Web de ST GEORGE'S HOSPITAL MEDICAL SCHOOL
- Web de LEIBNIZ-INSTITUT FUR PFLANZENBIOCHEMIE
- Web de THE CHANCELLOR, MÀSTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
- Web de MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
- Web de ROYAL HOLLOWAY AND BEDFORD NEW COLLEGE