Projet H2020 PhageFire : Une solution efficace et respectueuse de l'environnement pour lutter contre le feu bactérien causé par Erwinia amylovora dans les cultures de fruits à pépins

Une thérapie phagique ciblée innovante éradique la maladie du feu bactérien Une équipe de chercheurs financés par l'UE a dévoilé une technologie unique en son genre qui utilise des virus naturels pour aider à lutter contre le feu bactérien des fruits à pépins. Cette solution non toxique évolue avec les bactéries, éliminant complètement la maladie où qu’elle réside sur la plante.

Le feu bactérien est une maladie bactérienne dévastatrice causée par Erwinia amylovora qui affecte de nombreuses plantes de la famille des rosiers, en particulier les fruits à pépins tels que les pommes, les poires et les coings. Originaire d'Amérique du Nord, il s'est répandu en Europe dans les années 1950 et est aujourd'hui présent dans le monde entier, causant chaque année des dommages importants aux cultures en infectant les fleurs et en tuant les éperons et les tissus des fruits. Malgré une réglementation stricte, elle reste la maladie la plus destructrice dans les vergers de fruits à pépins.

Le projet PhageFire, financé par l'UE, visait à améliorer la lutte contre le feu bactérien dans les fruits à pépins en développant un biopesticide utilisant des bactériophages (virus naturels) ciblant spécifiquement les souches d'Erwinia amylovora. Ces bactériophages utilisent une activité lytique, ce qui signifie qu’ils peuvent pénétrer et décomposer les cellules bactériennes responsables du feu bactérien. Une alternative écologique pour lutter contre le feu bactérien « La saison prochaine, nous présenterons, pour la première fois sur le marché, une solution sûre et non toxique pour les producteurs de fruits à pépins pour lutter contre le feu bactérien grâce à la phagothérapie », explique le coordinateur du projet Borja de Santos Prieto.

« PhageFire est un cocktail soigneusement élaboré contenant des bactériophages sélectionnés ciblant spécifiquement la bactérie Erwinia amylovora, sans nuire aux autres organismes. Notre produit peut atteindre les bactéries où qu'elles se trouvent : sur les fleurs, les branches, le bois, les chancres et autres espèces hôtes ; elles ne se contentent pas de se disputer l'espace », ajoute de Santos Prieto. « Il est respectueux de l’environnement et ne génère pas de résistance, conformément aux pratiques agricoles durables promues par la Commission européenne. »

De plus, PhageFire se présente sous une forme liquide facile à appliquer à l’aide d’équipements agricoles classiques. Surmonter les défis La caractérisation des bactériophages a nécessité un travail intense en laboratoire. Tout a commencé par l’isolement des bactériophages et l’identification de leurs gènes, suivis par le test de leur capacité lytique et l’amélioration de leur résistance aux conditions environnementales défavorables telles que les rayons ultraviolets. Des recherches approfondies dans la littérature ont également été menées pour identifier les meilleurs moyens de protéger ces cocktails en laboratoire, garantissant ainsi leur performance sur le terrain. Les partenaires du projet ont mené plus de dix essais sur le terrain dans des vergers de fruits à pépins conformément aux normes européennes. La technologie de production industrielle est déjà en place pour répondre à la demande, avec la capacité de produire PhageFire dans de grands biofermenteurs de 5 000 litres. De belles perspectives pour les thérapies par phages.

Malgré sa longue histoire, la recherche et les applications sur les phages restent un domaine florissant avec un immense potentiel. « Étant donné que la phagothérapie est relativement nouvelle à ce stade, nos partenaires industriels ont développé avec succès un produit de pointe, positionnant PhageFire comme une solution leader sur le marché pour lutter contre le feu bactérien, un problème qui manquait auparavant de remède spécifique », explique de Santos Prieto. Grâce à l’expérience des partenaires industriels dans les applications des bactériophages, il existe un potentiel pour développer des technologies similaires pour d’autres problèmes. Comme le souligne le coordinateur du projet, les méthodes actuelles sont coûteuses et impliquent l’élimination des branches infectées, le déracinement des arbres, l’utilisation de pulvérisations à base de cuivre ou de traitements non spécifiques qui ne parviennent pas à éliminer les bactéries.

Les producteurs sont donc obligés de coexister avec les bactéries du feu bactérien, ce qui entraîne inévitablement des pertes économiques et de production. « PhageFire va plus loin en tuant les bactéries, éradiquant ainsi complètement la maladie. Il ne laisse aucun résidu, car les bactériophages se dégradent naturellement une fois les bactéries éliminées. Cela contribue à améliorer la productivité des producteurs de fruits à pépins, garantissant un approvisionnement fiable en fruits », conclut de Santos Prieto. Les consommateurs peuvent ainsi bénéficier d’une disponibilité plus constante et de prix potentiellement meilleurs, tout en savourant des fruits plus sains grâce au besoin réduit de traitements chimiques.