Groupe opérationnel EQUIGENIA : Une plateforme numérique innovante basée sur les données génomiques et l'intelligence artificielle appliquées à l'élevage, à la santé et à l'amélioration génétique du secteur équin

La sélection d'une population de chevaux PRE présentant des données phénotypiques et généalogiques complètes permettra d'établir une base solide pour améliorer les pratiques d'élevage et faciliter la prise de décision dans les exploitations. Un protocole clair de sélection des animaux de référence sera défini, et une base de données affinée et validée, contenant des informations fiables pour chaque individu, sera créée. De plus, une liste définitive des animaux à génotyper sera établie. Pour les éleveurs, ces résultats se traduiront par des données précises qui faciliteront la sélection des reproducteurs avec une plus grande confiance, réduiront les coûts liés aux erreurs de sélection et amélioreront la qualité génétique de leur troupeau. Ces informations consolidées permettront le développement d'outils de sélection et de gestion plus efficaces, directement applicables à la planification de la reproduction.

Les génotypes de 4 000 chevaux PRE issus de la population de référence seront obtenus grâce à la puce Axiom EQUIGENE, avec un indice de qualité supérieur à 90 %. L’ADN sera extrait de tous les échantillons et un génotypage complet sera réalisé, générant des données fiables et comparables. Des rapports de contrôle qualité seront ensuite établis et les résultats obtenus par d’autres technologies seront intégrés à ceux de la puce EQUIGENE. Pour les éleveurs, ces résultats se traduiront par des informations génétiques précises permettant une sélection plus fine des reproducteurs, une meilleure réponse à la sélection et une rentabilité optimisée de l’élevage. Les données générées faciliteront des décisions plus éclairées et réduiront les risques liés à la planification de la reproduction et à l’amélioration génétique du PRE.

Des modèles d'évaluation génomique seront développés et validés pour tous les critères de sélection des PRE, y compris les caractères fonctionnels et sanitaires. L'ensemble final des données phénotypiques et génomiques sera préparé et affiné, et des versions préliminaires des modèles pour les caractères prioritaires seront élaborées. Par la suite, les modèles définitifs seront mis en œuvre, les héritabilités seront estimées et la précision des valeurs génomiques sera quantifiée, les résultats étant documentés. Pour les éleveurs, cette avancée fournira des outils de sélection beaucoup plus fiables, capables de prédire avec une plus grande précision le potentiel reproductif et fonctionnel de chaque animal. Ceci facilitera des décisions plus rentables, réduira les risques liés à la sélection des reproducteurs et permettra d'améliorer la santé, la fonctionnalité et la qualité génétique du troupeau de PRE à moyen et long terme.

Des équations de prédiction génomique, basées sur l'influence de marqueurs, seront développées afin de mettre à jour les évaluations et d'obtenir des valeurs génétiques fiables chez les jeunes animaux non encore inclus dans les évaluations traditionnelles. La méthodologie sera définie, les premiers algorithmes implémentés et l'ensemble de données nécessaire à la validation de ces équations sera sélectionné. Une fois développées, ces équations seront validées et leur capacité à prédire avec une grande fiabilité le potentiel génétique des jeunes animaux sera démontrée. Pour les éleveurs, ces équations permettront d'identifier plus tôt les poulains présentant le meilleur potentiel reproductif, facilitant ainsi les décisions de sélection et optimisant les investissements en élevage. Il en résultera une amélioration plus rapide et plus efficace des performances, de la fonctionnalité et de la qualité génétique du PRE (Pur-sang espagnol), avec à la clé une réduction des délais et des coûts de prise de décision.

Un système prédictif sera développé pour estimer les caractéristiques des futurs poulains à partir des croisements proposés par chaque éleveur, en tenant compte de diverses caractéristiques et en quantifiant la précision de chaque estimation. Les algorithmes nécessaires seront définis et des tests initiaux seront menés sur des cas concrets sélectionnés par des éleveurs de renom. Le modèle final sera ensuite implémenté et ses résultats validés à l'aide de données issues de trios père-mère-descendants. Pour les éleveurs, ce système permettra d'anticiper le potentiel génétique de chaque croisement avant sa réalisation, les aidant ainsi à concevoir des croisements plus rentables et conformes aux objectifs de l'élevage. Ceci facilitera l'amélioration des qualités fonctionnelles, morphologiques et sanitaires des futures générations de chevaux de race pure espagnole (PRE), réduisant l'incertitude et optimisant la stratégie de reproduction.

Une plateforme numérique fonctionnelle sera développée, intégrant la collecte de données, les analyses génomiques, la gestion des accouplements et la prédiction des aptitudes de la descendance au sein d'un environnement unique. L'architecture complète et les principaux modules seront conçus, et un premier prototype fonctionnel sera créé pour des tests internes. La version finale sera ensuite mise en œuvre, dotée d'une interface intuitive validée par l'équipe technique et conçue pour une utilisation simplifiée par les éleveurs. Cet outil permettra un accès aisé aux données génétiques, la simulation d'accouplements et la prédiction des aptitudes de la descendance, améliorant ainsi les décisions de sélection et optimisant la stratégie de reproduction. La plateforme réduira les délais de traitement, centralisera l'information et facilitera une gestion plus efficace, rentable et basée sur les données.

Un chatbot intégré sera développé pour la plateforme numérique. Il sera capable de fournir des réponses précises et cohérentes aux questions prédéfinies concernant l'interprétation des valeurs génomiques, l'utilisation des différents modules et la résolution des questions fréquentes. La base de connaissances, comprenant une FAQ et un glossaire, sera définie et mise en ligne. Une première version du moteur d'IA générative sera implémentée pour des tests initiaux. Le chatbot sera ensuite entraîné, testé de manière approfondie avec une liste de questions réelles et validé jusqu'à l'obtention du taux de réponse attendu. Pour les éleveurs, cet outil offrira une assistance immédiate et accessible, facilitant la compréhension des résultats génétiques et l'utilisation efficace de la plateforme. Il permettra d'obtenir des réponses instantanées, de réduire les erreurs opérationnelles et d'accélérer les décisions de gestion et de sélection.

L'objectif de cette diffusion est de communiquer des informations sur le groupe opérationnel et le projet au secteur équin et au grand public. Le projet établira une communication claire et continue avec le secteur équin et le grand public, créant ainsi une structure solide pour coordonner toutes les activités d'information et de formation. Des objectifs, des messages clés et un calendrier seront définis, et les médias sociaux, les sites web et des bulletins d'information multilingues seront utilisés pour garantir que les résultats parviennent rapidement et efficacement à toutes les parties prenantes. Pour les éleveurs, les vétérinaires et les entreprises, cela signifie un accès direct à des informations actualisées qui facilitent des décisions plus éclairées, réduisent l'incertitude et améliorent la planification de leurs opérations. Grâce à un contenu pratique, des messages personnalisés et une présence constante sur les médias numériques, les professionnels pourront immédiatement tirer parti des nouveaux outils, rester informés de l'avancement du projet et améliorer la compétitivité de leurs entreprises grâce à une communication fiable et accessible, conçue pour soutenir leurs activités quotidiennes.

L'objectif de diffusion est de mettre en place des canaux de partage des résultats du projet avec toutes les parties prenantes. Le projet diffusera ses conclusions dans l'ensemble du secteur équin grâce à des supports pratiques, des ateliers techniques, des articles informatifs et scientifiques, la participation à des salons professionnels et des formations directes. Ceci permettra aux éleveurs, aux vétérinaires et aux entreprises de découvrir et d'appliquer les nouveaux outils et connaissances acquis, notamment la plateforme et les analyses génomiques. Les principaux avantages seront des décisions de reproduction plus précises, une amélioration génétique accélérée, une réduction des coûts de sélection et une compétitivité accrue des exploitations. Par le biais de conférences, de formations, de revues spécialisées et de réunions virtuelles, les professionnels pourront rapidement intégrer ces innovations à leur pratique quotidienne, optimiser la gestion de leurs exploitations et saisir de nouvelles opportunités commerciales dans un environnement de plus en plus axé sur les données.