H2020 BovReg Proiektua: BovReg: Behien fenotipo-dibertsitatearekin eta plastizitatearekin lotutako ezaugarri genomiko funtzionalki aktiboen identifikazioa

Abeltzaintza Hobetzeko Ikuspegi Genomikoak Aldakortasun Genetikoen atzean dauden mekanismo biologikoak ulertzeak nekazariei abeltzaintza eraginkortasunez hazten eta animalien ongizatea hobetzen lagun diezaieke. Informazio genomikoa (organismo batek hazteko eta funtzionatzeko behar dituen zelula-datuak) aspalditik aztertu eta erabili izan da abere sendoagoak eta osasuntsuagoak hazteko. Desabantaila nagusi bat da aldaera genetiko batzuen oinarrian dauden mekanismo biologikoak oraindik ez direla ondo ulertzen.

Beraz, abereen osasunerako eta ongizaterako ondorioak aurreikusezinak izan daitezke, ezaugarri genetiko batzuek aurreikusi gabeko albo-ondorioak izan baititzakete. BovReg proiektuak biologian oinarritutako ikuspegi baterantz jotzea bilatu zuen, non aldaera genetiko espezifiko baten funtzioa hobeto ulertzen den. «Eremu hau oraindik oso ezezaguna da», dio Christa Kuehnek, BovReg proiektuaren koordinatzaileak, gaur egun Alemaniako Friedrich-Loeffler Institutuan lanean ari denak. "Hala ere, badakigu proteina bihurtzen ez den genomaren % 95ek baino gehiagok funtzioren bat izan behar duela; bestela, eboluzioak ez luke milioika urtez mantenduko." Genomaren eskualde erregulatzaileak ikertzen Kuehnek eta bere lankideek genomaren eskualde erregulatzaile hauek ikertu nahi zituzten. Mekanismo horiek argitzeko, Alemaniako Abeltzaintzako Animalien Biologiako Ikerketa Institutuak koordinatutako proiektuak behi-ehunetik eta ohiko zelula-lerroetatik partekatutako datu genomiko funtzional ugari sortu zituen. Helburua behien sendotasunarekin eta osasunarekin lotutako ezaugarrien ulermen askoz zehatzagoa ezartzea zen.

Horretarako, proiektuak bioinformatika-bideak ere garatu zituen datuen analisia erreproduzigarria eta plataforma desberdinetan elkarreragingarria izan zedin ziurtatzeko. «Datu kopuru izugarria sortu zen, eta hori ikerketa biomedikorako ere erabil daiteke», azaldu du Kuehnek. "Informazio hau erabilgarria eta eskuragarria zela ziurtatu nahi genuen." Datu guztiak mundu mailako datu-atari publiko batean sartuko dira. «Mapaketa etikoa ere egin genuen ugalketa genomikoaren inguruko pertzepzio sozialak grafikoki irudikatzeko», gaineratu du Kuehnek. "Ikerketak batzuetan gizarte-hausturak edo erresistentziak sor ditzake, beraz, gizartean izan ditzakeen ondorio potentzialak aurreikusi eta aztertu nahi izan ditugu." Animalien genomaren anotazio funtzionala BovReg proiektuaren emaitzek FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes) proiektu globalean ere lagundu dute, mundu osoko abereen ikerketa genomikoa biltzen duen erakunde batean. FAANG komunitatea ENCODE ekimenarekin batera ari da lanean. Hau giza genomaren funtzioa karakterizatzera bideratuta dago. BovReg-ek EuroFAANG sortu zuen elkarrekin, EBk finantzatutako sei proiekturen aterki ekimena, eta datu-kanal komunak eta protokolo orokorrak adostu dituzte, ezagutza ahalik eta gehien zabaltzen dela bermatzeko.

EuroFAANG aterki honetan oinarrituta, duela bi urte EBko finantzaketa gehiago lortu zen EuroFAANG Ikerketa Azpiegitura izeneko proiektu baterako, eta horrek etorkizunean lankidetza hau jarraitzeko beharrezko azpiegitura ezarriko du. «BovReg bezalako proiektu baten ondorengo erronka nagusietako bat jendea elkarrekin mantentzea eta komunitatea jarraitzea bermatzea da», dio Kuehnek. Behi-hazkuntza praktikak hobetzea Kuehnek eta bere taldeak uste dute BovReg proiektuaren aitzindari-lanak hazkuntza praktikak hobetzen lagunduko duela. «Zenbat eta gehiago jakin funtzio genomikoari buruz, orduan eta gehiago saihestu ditzakegu hazkuntzaren albo-ondorio kaltegarriak», adierazi du. "Horrek baliabideak aurreztu eta animalien ongizatea hobetu dezake." Informazio genomiko hobeak animalien kudeaketa eta albaitaritza-esku-hartze zuzenduagoak ere ekar ditzake. «Animalia-populazio batzuek beste batzuek baino onura gehiago atera dezakete tratamendu pertsonalizatutik», gaineratu du Kuehnek. "Funtzio genomikoen ulermena hobetzeak animalien benetako beharrak ulertzen lagun diezaguke."