Proxecto H2020 BovReg: BovReg: Identificación de trazos xenómicos funcionalmente activos relevantes para a diversidade fenotípica e a plasticidade no gando vacún

Enfoques xenómicos para unha mellor cría de gando Comprender os mecanismos biolóxicos que subxacen ás variacións xenéticas podería axudar aos agricultores a críar gando de forma eficiente e mellorar o benestar animal. A información xenómica (os datos celulares que un organismo necesita para crecer e funcionar) leva moito tempo sendo analizada e utilizada para criar gando máis forte e saudable. Unha desvantaxe clave é que os mecanismos biolóxicos subxacentes a certas variantes xenéticas aínda non se coñecen amplamente.

Polo tanto, as consecuencias para a saúde e o benestar do gando poden ser imprevisibles, xa que certos trazos xenéticos poden ter efectos secundarios imprevistos. O proxecto BovReg buscaba avanzar cara a unha abordaxe máis baseada na bioloxía, onde se comprenda mellor a función dunha variante xenética específica. «Esta é aínda unha área moi descoñecida», afirma Christa Kuehn, coordinadora do proxecto BovReg, que traballa actualmente no Instituto Friedrich-Loeffler de Alemaña. "Non obstante, sabemos que máis do 95 % do xenoma que non se traduce en proteínas debe ter algunha función; se non, a evolución non o tería mantido durante millóns de anos". Investigación das rexións reguladoras do xenoma Kuehn e os seus colegas querían investigar estas rexións reguladoras do xenoma. Para descubrir estes mecanismos, o proxecto, coordinado polo Instituto de Investigación de Bioloxía de Animais de Granxa de Alemaña, xerou grandes cantidades de datos xenómicos funcionais compartidos de tecido bovino e liñas celulares de uso común. O obxectivo era establecer unha comprensión moito máis detallada dos trazos relacionados coa robustez e a saúde do gando.

Con este fin, o proxecto tamén desenvolveu canles bioinformáticas para garantir que a análise de datos fose reproducible e interoperable en diferentes plataformas. «Xerouse unha enorme cantidade de datos, que tamén se poden empregar para a investigación biomédica», explica Kuehn. "Queriamos asegurarnos de que esta información fose utilizable e accesible." Todos os datos incorporaranse nun portal de datos público global. «Tamén realizamos un mapeo ético para representar graficamente as percepcións sociais sobre a reprodución xenómica», engade Kuehn. "A investigación pode ás veces causar disrupción ou reticencia social, polo que quixemos anticipar e analizar as súas posibles implicacións para a sociedade." Anotación funcional de xenomas animais Os resultados do proxecto BovReg tamén se incorporaron ao proxecto global FAANG (Anotación Funcional de Xenomas Animais), unha organización que reúne a investigación xenómica en animais de granxa de todo o mundo. A comunidade FAANG está a operar en paralelo coa iniciativa ENCODE. Está dedicado a caracterizar a función do xenoma humano. BovReg cocreou EuroFAANG, unha iniciativa xenérica de seis proxectos relacionados financiados pola UE, que acordaron canles de datos comúns e protocolos globais, garantindo que o coñecemento se difunda o máis amplamente posible.

Baseándose neste paraugas de EuroFAANG, hai dous anos conseguiuse financiamento adicional da UE para un proxecto chamado Infraestrutura de Investigación de EuroFAANG, que establecerá a infraestrutura necesaria para continuar esta cooperación no futuro. «Un dos principais retos despois dun proxecto como BovReg é manter á xente unida e garantir que a comunidade continúe», di Kuehn. Mellora das prácticas de cría de gando Kuehn e o seu equipo cren que o traballo pioneiro do proxecto BovReg axudará a mellorar as prácticas de cría. "Canto máis saibamos sobre a función xenómica, máis poderemos evitar os efectos secundarios nocivos da reprodución", sinala. "Isto podería aforrar recursos e mellorar o benestar animal." Unha mellor información xenómica tamén podería levar a unha xestión animal e a unha intervención veterinaria máis específicas. «Algunhas poboacións animais poden beneficiarse máis dun tratamento personalizado que outras», engade Kuehn. "Avanzar na nosa comprensión das funcións xenómicas pode axudarnos a comprender as necesidades reais dos animais."