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Projet H2020 VetBioNet : Réseau d'installations vétérinaires bioconfinées pour l'excellence en recherche et expérimentation sur les maladies infectieuses animales

  • Taper Projet
  • État Rempli
  • Exécution 2017 -2023
  • Budget alloué 9.999.140,5 €
  • Portée Europeo
  • Principale source de financement H2020
  • Site Web du projet Proyecto VetBioNet
Description des activités

Au total, 75 demandes d’accès à l’information (TNA) (dont 12 au cours de la quatrième période de référence) ont été reçues et traitées par le point d’accès à l’information (TNAAP). 51 projets (11 au cours de la quatrième période de rapport) ont été approuvés après examen par le comité de sélection des utilisateurs (USP). Les utilisateurs de TNA venaient de 20 pays différents (10 États membres de l’UE et 10 pays associés/tiers ou internationaux). Le Groupe de réponse aux menaces émergentes vétérinaires (VETRG) a été créé en tant que groupe consultatif pour discuter des approches à l'échelle du projet pour répondre aux menaces imminentes et/ou prévisibles des maladies infectieuses émergentes. Un appel interne à projets lié à la peste porcine africaine (PPA) ou aux infections zoonotiques à flavivirus a été lancé en novembre 2019 grâce à un Fonds d'urgence (FE) de 240 000 € destiné aux réponses de recherche urgentes et/ou prioritaires. Trois projets liés au PPA ont été sélectionnés pour bénéficier d’un soutien FE et ont été menés à bien au cours de la quatrième période de rapport.

L'utilisation d'un espace VetBioNet sur le site Web du Groupe de travail international sur la biosécurité vétérinaire (IVBW) a permis la large diffusion des résultats du projet sur les meilleures pratiques dans les installations pour animaux à haut confinement, y compris les installations pour animaux de ferme à haut confinement (HCFAF) et les installations pour animaux aquatiques. Huit lignes directrices de bonnes pratiques ont été publiées sur le site Web de VetBioNet.

Les activités du projet, qui questionnent les dimensions éthiques et sociales des travaux de recherche de VetBioNet, ont abouti à la production de six rapports publics ou documents d'orientation, ainsi qu'à diverses ressources et outils en ligne liés aux 3R (Remplacement, Réduction et Raffinement). Plus de 200 000 visiteurs et plus de 2 500 000 clics ont été enregistrés sur le site VetBioNet. Deux courtes vidéos présentant les thématiques de VetBioNet, disponibles sur YouTube, ont reçu au total plus de 1 000 appels. Trois webinaires ont été diffusés en direct et publiés sur le site Web de VetBioNet. Trois événements de formation ont été organisés au cours de la quatrième période de référence, soit cinq au total. Une base de données a été créée pour partager les données générées par le projet (y compris les entrées de données internes/confidentielles et publiques).

La pérennité de VetBioNet est obtenue, au moins en partie, grâce à la participation du réseau au consortium ISIDORe. Le Comité de durabilité de VetBioNet a lancé le processus de création d'un groupe de recherche européen VetBioNet (ERG), et un projet d'accord ERG a été distribué aux partenaires du réseau. Plusieurs modèles d’élevage ont été développés pour étudier l’infection par des virus animaux hautement pathogènes. Des modèles d'hôtes réservoirs ont été développés pour les études sur l'infection par le coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV), le virus de la grippe A (IAV) et le virus de la fièvre de la vallée du Rift. Des modèles animaux ont été développés pour étudier l’infection aéroportée par le SRAS-CoV-2 et l’IAV. Des modèles de poissons ont été développés pour des études d’infection par divers agents pathogènes viraux. De nombreux modèles d’infection alternatifs ont été développés à partir de cellules primaires immortalisées, d’organoïdes, d’explants de tissus viables et d’œufs de poule embryonnés. Des approches de transcriptomique et de séquençage profond ont été développées pour analyser la réponse de l'hôte du bétail (porcs, bovins, volailles) à l'infection par un agent pathogène ou la plasticité de l'infection virale au sein de l'hôte infecté.

Des tests de diagnostic ont été développés pour aider à accélérer la détection des agents pathogènes et des infections chez les lapins, les salmonidés et les ruminants. De nouveaux outils et protocoles de télémétrie ont été développés pour surveiller les paramètres physiologiques et le comportement du bétail, des poissons et des animaux de laboratoire.

Description contextuelle

VetBioNet est un projet d’infrastructure de 6 ans (2017-2023) réunissant 28 partenaires européens et internationaux de 12 pays différents. L’objectif global de VetBioNet est d’établir et de maintenir un réseau complet d’installations de confinement élevé de premier plan, d’organismes de recherche publics ou universitaires et de partenaires industriels dédiés à l’avancement de la recherche sur les maladies épizootiques et zoonotiques.

Pour atteindre cet objectif global, VetBioNet vise spécifiquement à : fournir un accès gratuit aux ressources d'infrastructure du réseau, y compris les installations ou laboratoires pour animaux bioconfinés, les plateformes technologiques et les collections d'échantillons ; Améliorer l’état de préparation des principales infrastructures européennes de recherche à haut niveau de confinement afin d’accélérer la réponse aux menaces (ré)émergentes des maladies épizootiques et zoonotiques ; harmoniser les meilleures pratiques et promouvoir l’utilisation de normes mondiales dans les installations pour animaux à confinement élevé ; Établir des relations de coopération avec des infrastructures de confinement élevé non européennes, des réseaux de recherche, l’industrie, des organisations internationales et des décideurs politiques ; garantir des normes éthiques élevées et clarifier l’impact social des travaux de recherche de VetBioNet ; et mener des activités de recherche visant à améliorer les normes scientifiques et technologiques des services offerts par le réseau.

Malgré l’impact évident de la pandémie de COVID-19 sur la performance du projet en 2020/21 (qui a nécessité une prolongation de 12 mois), le projet VetBioNet a atteint avec succès son objectif global et a réalisé les 101 livrables. Le réseau est désormais reconnu comme un acteur clé de la recherche européenne et de la réponse à la préparation aux épidémies (ré)émergentes de maladies infectieuses, et fait partie des 17 infrastructures ou réseaux de recherche participant au projet d'infrastructure ISIDORe (Integrated Services for Infectious Disease Outbreak Investigation) (Horizon Europe, 2022-25).

Objectifs

VetBioNet vise à compléter et à renforcer la capacité et la compétence européennes actuelles pour relever les défis des maladies infectieuses (ré)émergentes en établissant un réseau complet d'infrastructures européennes de niveau de sécurité de base 3 (BSL3), d'organisations internationales et de partenaires industriels de premier plan, dédiés à la stimulation de la recherche sur les maladies épizootiques et zoonotiques et à la promotion du développement technologique. Pour atteindre cet objectif global, VetBioNet :

  • Il favorisera et facilitera l'accès transnational (TNA) aux ressources d'infrastructure du réseau, y compris les installations et laboratoires d'essais sur les animaux BSL3, les plateformes technologiques et les collections d'échantillons.
  • Il favorisera le développement technologique en impliquant des partenaires privés dans l'activité d'intégration du réseau et en fournissant une plate-forme de communication pour un échange bidirectionnel avec les acteurs de l'industrie.
  • Il renforcera la préparation des principales infrastructures de recherche européennes BSL3 pour accélérer la réponse aux menaces épizootiques et zoonotiques (ré)émergentes en partageant des capacités au-delà des infrastructures.
  • Il harmonisera les bonnes pratiques et favorisera l’utilisation de normes mondiales dans les infrastructures européennes BSL3.
  • Établir des relations de coopération avec des infrastructures BSL3 non européennes, des instituts de recherche, des partenaires industriels, des organisations internationales et des décideurs politiques.
  • Assurer des normes éthiques élevées et clarifier l’impact social de la recherche VetBioNet.
  • Élaborer et mettre en œuvre un plan de durabilité pour garantir que le réseau continue au-delà de la date limite de financement de cinq ans.
  • Réaliser des activités de recherche conjointes (ARC) visant à améliorer les normes scientifiques et technologiques des services intégrés fournis par l'infrastructure du réseau. La création de ce réseau et la mise en œuvre du programme de travail proposé contribueront à améliorer l’efficacité de la recherche européenne sur les maladies épizootiques et zoonotiques émergentes, ce qui conduira à son tour à l’élaboration de mesures de prévention et de contrôle appropriées et robustes.
Résultats

Un réseau rationalise le travail de prévention et de contrôle des maladies animales liées aux agents pathogènes à haut risque en donnant accès à des installations, des outils et des services très recherchés. La pandémie actuelle a confirmé ce que les scientifiques savaient depuis longtemps. L’accélération du rythme de la recherche et de l’acquisition de connaissances sur les agents pathogènes à haut risque (hautement infectieux, hautement pathogènes ou les deux) est essentielle à notre sécurité. Les épidémies incontrôlées de maladies infectieuses ont un impact mondial sur les vies, les moyens de subsistance, les économies et les systèmes de santé. Il est essentiel de comprendre le fonctionnement de ces agents pathogènes pour prévenir et contenir la propagation des maladies. Cependant, précisément en raison de leur risque élevé, ces agents pathogènes doivent être étudiés dans des installations spécialisées à haut confinement, dont il existe peu dans le monde.

Le projet VetBioNet, financé par l'UE, a établi un réseau multidisciplinaire pour renforcer la coopération entre les principales installations européennes d'élevage d'animaux à haut niveau de confinement, améliorer les capacités techniques et les services et fournir un accès gratuit. Installation d'animaux à confinement élevé sans précédent VetBioNet a réuni la plupart des organismes de recherche européens dotés d'installations d'animaux à confinement élevé, ainsi que quatre partenaires en Afrique, en Amérique du Nord et en Australie, pour mener des recherches sur les maladies infectieuses chez les animaux terrestres et aquatiques.

Le réseau dispose de certaines des installations les plus coûteuses et techniquement les plus complexes, celles utilisées pour les expériences d’infection sur de gros animaux (bovins). « Ces installations de confinement élevé pour les animaux d'élevage sont rares - il n'y en a probablement pas plus de quelques dizaines dans le monde - et leur disponibilité pour les utilisateurs transnationaux est une caractéristique unique du projet VetBioNet », note Sascha Trapp de l'Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (INRAE) et coordinateur de VetBioNet. Nouveaux outils et recherches sur les maladies zoonotiques et épizootiques Les recherches de VetBioNet couvrent les maladies animales importantes qui ne peuvent pas être transmises à l'homme, comme la peste porcine africaine, et celles qui le peuvent (maladies zoonotiques), comme la COVID-19 et la grippe aviaire, y compris les maladies épizootiques (épidémies de maladies épidémiques dans les populations animales). Les activités de recherche conjointes du consortium ont généré de nombreux modèles de maladies, protocoles et technologies de surveillance pour accélérer notre compréhension de ces maladies. Parmi les nombreux modèles animaux et alternatifs, on trouve le premier modèle d’infections aériennes par le SARS-CoV-2 chez les furets. De nouveaux outils et protocoles génétiques visant à améliorer la compréhension de l’infection et de l’immunité chez les bovins s’appuient sur la transcriptomique, le génotypage à haut débit et les protocoles de séquençage de nouvelle génération.

Les technologies ou protocoles de capteurs permettront de surveiller les paramètres physiologiques et le comportement du bétail, des animaux de laboratoire et des poissons afin d’améliorer les normes éthiques et technologiques de la recherche animale et de soutenir la prévention et le traitement. Les installations ont été très demandées par les utilisateurs externes. En juin 2022, il y avait 51 projets d'utilisateurs d'accès transnationaux représentant 21 pays différents (dont 6 non européens) et une combinaison d'universités, d'institutions de recherche publiques et de PME. Du SARS-CoV-2 d’aujourd’hui aux maladies infectieuses épidémiques de demain, VetBioNet a joué un rôle central dans la lutte contre le COVID-19. Marie-Isabelle Thoulouze, de l’INRAE et coordinatrice adjointe de VetBioNet, explique : « Plusieurs partenaires de VetBioNet étudiaient les coronavirus zoonotiques dans le cadre de leurs activités avant la pandémie.

Ils ont réagi rapidement et efficacement, obtenant ainsi des informations précieuses sur la sensibilité des animaux et les risques pour les humains. Trapp ajoute que « des modèles animaux de laboratoire pour les études d'infection par le SRAS-CoV-2, y compris les études d'efficacité préclinique, sont actuellement disponibles dans toutes les installations animales à confinement élevé de VetBioNet ». Le consortium VetBioNet est à l'avant-garde de la réponse de la recherche européenne aux menaces de maladies zoonotiques et épizootiques. Le réseau est désormais l’une des 17 infrastructures de recherche en sciences de la vie du projet ISIDORe, le plus grand et le plus diversifié des centres de recherche et de prestation de services pour l’étude des maladies infectieuses en Europe. VetBioNet aidera ISIDORe à améliorer la capacité de l'Europe à contrôler les maladies infectieuses (ré)émergentes et épidémiques.

Informations Complémentaires

L'accès TNA fourni par le projet VetBioNet consistait en un accès gratuit aux ressources d'infrastructure rares et très recherchées du réseau. L'appel à projets TNA a été organisé sous forme d'appel permanent (de janvier 2018 à septembre 2022) et a abouti à la mise en œuvre réussie de 51 projets d'utilisateurs, dont trois projets avec des utilisateurs du secteur privé. Les activités de recherche conjointes (ARC) menées par les partenaires visaient à améliorer les normes scientifiques et techniques des services offerts par VetBioNet. Les JRA ont facilité le développement de nouveaux modèles animaux vivants ou alternatifs pour diverses maladies épizootiques et zoonotiques à fort impact. D’autres JRA ont contribué à l’avancement des approches actuelles d’analyse, de télémétrie et de bioimagerie dans la recherche sur les maladies infectieuses animales. Cinq partenaires privés ont participé directement aux JRA VetBioNet, permettant un développement technologique avec un niveau avancé de maturité technologique et la commercialisation potentielle de certains résultats du projet.

L'objectif général des activités de réseau (AN) du projet était de favoriser la coopération entre les partenaires du consortium et de forger des relations de coopération avec d'autres initiatives de recherche européennes ou internationales, des acteurs industriels, des organisations internationales et des décideurs politiques. Un plan de préparation a été lancé pour faire de VetBioNet un acteur clé dans la réponse d’urgence européenne aux épidémies de maladies infectieuses. Les AN de VetBioNet, qui traitent des meilleures pratiques et de l'harmonisation des protocoles et des procédures, ont contribué à l'avancement des normes de biosécurité dans les installations de recherche à haut confinement et pourraient servir de base aux futures lignes directrices ou réglementations de l'UE. Les AN remettant en question les dimensions éthiques et sociales des activités de recherche de VetBioNet ont donné lieu à plusieurs rapports publics et représentent une approche des sciences sociales probablement unique parmi les projets européens d'infrastructure des sciences de la vie One Health.

Coordonnateurs
  • INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE POUR L'AGRICULTURE, L'ALIMENTATION ET L'ENVIRONNEMENT (INRAE)