Projet H2020 MycoSynVac : Ingénierie de Mycoplasma pneumoniae comme vaccin animal à large spectre

WUR a développé un modèle dynamique de cellules entières pour le métabolisme de M. pneumoniae et, sur la base de ces modèles, a développé un modèle basé sur des contraintes à l'échelle du génome pour M. hyopneumoniae, afin d'optimiser les vaccins. WUR a également déployé ses modèles métaboliques pour évaluer, à l'échelle génomique, les capacités métaboliques d'une gamme de mycoplasmes afin de concevoir un portefeuille de vaccins sur mesure.

CRG a développé deux méthodes d’ingénierie du génome pour M. pneumoniae. En conséquence, un châssis non pathogène a été généré qui peut survivre dans les poumons des souris aussi longtemps que Mycoplasma pneumoniae WT, qui ne déclenche pas de lésion pulmonaire et présente une réponse inflammatoire réduite. Ce châssis peut exprimer des protéines hétérologues et des adjuvants protéiques sur sa surface pour la vaccination. Les gènes essentiels à la survie dans les poumons des souris qui ne peuvent pas être retirés du châssis ont été déterminés.

ICL a conçu, optimisé et testé ses circuits de biosécurité sur la souche WT, qui présentent une bonne efficacité d'élimination lorsqu'ils sont activés. De plus, l’intégration de la redondance améliore le système de biosécurité. Des résultats très prometteurs ont été obtenus lors de compétitions entre pairs qui ont testé les différents systèmes de biosécurité développés en utilisant des modèles de souris in vivo. Les circuits de biosécurité ont également été transformés en souches de châssis. Dans ce cas, les circuits ont dû être réoptimisés et tous les cas n’ont pas été couronnés de succès. La meilleure souche générée est une CV2 avec deux copies des circuits KS1 réoptimisés.

L'INRA a développé une méthode appelée Genomic Transfer-Recombinase-Mediated Cassette Exchange (GT-RMCE). Cette nouvelle technologie permet des modifications génomiques à grande échelle sur des loci spécifiques de M. pneumoniae. Il permet d’insérer et de remplacer de grands fragments d’ADN et de supprimer des gènes, et pourrait être étendu pour introduire des mutations ponctuelles. Tous ces nouveaux outils ont permis l’inactivation de facteurs de virulence connus de M. pneumoniae et ont conduit à la construction de prototypes de châssis de vaccin.

ATG a terminé la sélection des peptides candidats à inclure dans les protéines chimériques pour la production de vaccins ; 44 ont été sélectionnés pour Mycoplasma hyopneumoniae et 23 pour Mycoplasma bovis. De plus, l'analyse de 64 souches du virus du syndrome dysgénésique et respiratoire porcin (SDRP) par des puces à peptides a permis la sélection de 20 peptides candidats supplémentaires pour ce virus. Les peptides ont été combinés en 8 protéines chimériques pour M. hyopneumoniae, 6 pour M. bovis et 4 pour le PRRSV.

MSD a mené huit expériences à grande échelle sur des animaux pour évaluer les différents vaccins générés dans le cadre du projet. L'expression d'antigènes hétérologues à la surface d'un châssis atténué de M. pneumoniae, cultivé dans un milieu sans sérum, est sans danger chez les animaux destinés à l'alimentation en tant que vaccin inactivé et produit une séroconversion à tous les antigènes exposés. Les résultats préliminaires indiquent également que les variantes du châssis pourraient être sûres en tant que vaccin vivant atténué, car les bactéries ne peuvent pas être détectées dans d’autres parties du corps que le site d’injection. Des expériences animales supplémentaires seraient nécessaires pour conclure sur l’efficacité de ces vaccins.

Les travaux menés par l’UCPH sur les préoccupations sociales ont également établi que, bien qu’il existe une large acceptation générale de l’utilisation d’un vaccin synthétique pour le bétail en Europe, les perceptions d’un tel vaccin diffèrent considérablement d’un pays à l’autre. Leurs activités d’auto-conversation ont aidé nos chercheurs à réfléchir à la manière dont leur travail pourrait être perçu par d’autres parties prenantes concernées.

Biofaction a développé une grande variété de différents types d'engagement public, allant des interactions en personne dans les cafés scientifiques, des visites de lycées et des événements de communication scientifique publique aux activités en ligne telles que des vidéos d'animation à cinq personnages, un court documentaire scientifique et le jeu scientifique « Battle for Cattle » pour le Web et les appareils mobiles.