H2020 BovReg proiektua: BovReg: behien aniztasun fenotipikoaren eta plastikotasunaren ezaugarri genomiko funtzionalki aktiboen identifikazioa.

Abeltzaintza Hobetorako Planteamendu Genomikoak Aldaera genetikoen atzean dauden mekanismo biologikoak ulertzeak nekazariei abereak modu eraginkorrean hazten eta animalien ongizatea hobetzen lagun diezaieke. Informazio genomikoa (organismo batek hazteko eta funtzionatzeko behar dituen datu zelularrak) aspalditik aztertu eta erabiltzen da abere indartsuagoak eta osasuntsuagoak hazteko. Funtsezko desabantaila da aldaera genetiko batzuen azpian dauden mekanismo biologikoak oraindik ez direla oso ulertzen.

Hori dela eta, abeltzaintzaren osasunean eta ongizatean izango diren ondorioak ezustekoak izan daitezke, ezaugarri genetiko jakin batzuek ezusteko albo-ondorioak izan ditzaketelako. BovReg proiektuak biologian oinarritutako ikuspegi baterantz jo nahi zuen, non aldaera genetiko zehatz baten funtzioa hobeto ulertzen den. «Oraindik oso eremu ezezaguna da», dio Christa Kuehn, BovReg proiektuaren koordinatzaileak, gaur egun Alemaniako Friedrich-Loeffler Institutuan. "Hala ere, badakigu proteinetara itzultzen ez den genomaren % 95ak baino gehiagok funtzioren bat izan behar duela; bestela, eboluzioak ez zuen milioika urtez mantenduko". Genomaren erregulazio-eskualdeak ikertzen Kuehn-ek eta bere lankideek genomaren erregulazio-eskualde horiek ikertu nahi izan zituzten. Mekanismo horiek ezagutzeko, Alemaniako Baserriko Animalien Biologiako Ikerketa Institutuak koordinatutako proiektuak partekatutako datu genomiko funtzional ugari sortu zituen behi-ehunetatik eta erabili ohi diren zelula-lerroetatik. Helburua ganaduaren sendotasunari eta osasunari lotutako ezaugarrien ulermen askoz zehatzagoa ezartzea zen.

Horretarako, proiektuak bioinformatika kanalizazioak ere garatu zituen, datuen analisia plataforma desberdinetan erreproduzigarria eta elkarreragingarria izan zela ziurtatzeko. "Datu kopuru handia sortu zen, ikerketa biomedikorako ere erabil daitezkeenak", azaldu du Kuehnek. "Informazio hori erabilgarri eta eskuragarria zela ziurtatu nahi genuen". Datu guztiak datu publikoen atari global batean sartuko dira. "Mapa etikoa ere egin dugu ugalketa genomikoaren inguruko pertzepzio sozialak grafikoki irudikatzeko", gaineratu du Kuehnek. «Ikerketek, batzuetan, gizarte-haustura edo errezeloa eragin dezakete, beraz, gizartean izan ditzakeen ondorioak aurreikusi eta aztertu nahi izan ditugu». Animalien genomaren oharpen funtzionala BovReg proiektuaren emaitzak FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes) proiektu globalean ere elikatu dira, mundu osoko baserriko animalien ikerketa genomikoa biltzen duen erakundea. FAANG komunitatea ENCODE ekimenarekin paraleloan ari da lanean. Hau giza genomaren funtzioa ezaugarritzea da. BovRegek elkarrekin sortu zuen EuroFAANG, EBk finantzatutako sei proiekturen aterki ekimena, datu-kanal komunak eta protokolo orokorrak adostu dituztenak, ezagutza ahalik eta gehien zabaltzen dela bermatuz.

EuroFAANG aterki honetan oinarrituta, duela bi urte EBko finantzaketa gehiago lortu zen EuroFAANG Research Infrastructure izeneko proiekturako, etorkizunean lankidetzan jarraitzeko beharrezko azpiegiturak ezarriko dituena. "BovReg bezalako proiektu baten ostean erronka nagusietako bat jendea elkarrekin mantentzea eta komunitateak jarraitzea da", dio Kuehnek. Behi-hazkuntza-praktikak hobetzea Kuehnek eta bere taldeak uste dute BovReg proiektuaren aitzindariak ugaltzeko praktikak hobetzen lagunduko duela. "Zenbat eta gehiago dakigu funtzio genomikoari buruz, orduan eta gehiago saihestu ahal izango ditugu ugalketaren albo-ondorio kaltegarriak", adierazi du. «Horrek baliabideak aurreztu eta animalien ongizatea hobetu ditzake». Informazio genomiko hobeak animalien kudeaketa eta albaitaritzako esku-hartze bideratuagoak ere ekar ditzake. "Animalien populazio batzuek tratamendu pertsonalizatutik etekin handiagoa izan dezakete beste batzuek baino", gaineratu du Kuehnek. "Funtzio genomikoen ulermenak aurreratzeak animalien benetako beharrak ulertzen lagun diezaguke".