Projet H2020 XF-ACTORS : Confinement actif de Xylella Fastidiosa grâce à une stratégie de recherche multidisciplinaire
- Taper Projet
- État Rempli
- Exécution 2016 -2021
- Budget alloué 6.903.000,00 €
- Portée Europeo
- Principale source de financement H2020
- Site Web du projet Proyecto XF-ACTORS
XF-ACTORS a permis la mise en place en Europe, pour la première fois, d’un programme de recherche multidisciplinaire pour lutter contre ce pathogène nocif. Un réseau a été établi qui facilite un échange fructueux de connaissances entre différents experts et disciplines : biologie, génétique, bioinformatique, entomologie, épidémiologie et modélisation, etc.
Nous savons que trouver une thérapie contre Xylella est un objectif ambitieux à long terme ; Cependant, XF-ACTORS a mis en lumière divers aspects des épidémies dans l'UE : de l'agressivité à la gamme d'hôtes des différentes souches de l'UE ; des schémas de propagation des maladies à l’épidémiologie dans différents agroécosystèmes ; et des connaissances sur les insectes vecteurs qui jouent un rôle crucial dans la propagation des infections. Toutes ces informations scientifiques étaient essentielles pour que la Commission européenne puisse élaborer des dispositions/mesures législatives de protection et mettre en œuvre des stratégies préventives. En fait, l'équipe de modélisateurs, qui travaille à développer des modèles qui prédisent les endroits les plus à risque et la propagation du pathogène une fois qu'une épidémie est détectée, a profité des connaissances scientifiques limitées recueillies tout au long des différentes tâches du projet.
Toutes les informations biologiques, par exemple, ont été utilisées pour ajuster les paramètres du modèle, afin de mettre en œuvre des modèles aussi proches que possible des scénarios de maladies réelles. Les activités et les connaissances acquises dans le cadre de XF_ACTORS ont inspiré et orienté le plan de travail d'autres projets de recherche qui ont construit leur programme de recherche en bénéficiant du contexte développé au sein de XF-ACTORS : c'est-à-dire les projets BIOVEXO, CURE-XF et ERC-MULTIX. Plusieurs autres initiatives de recherche nationales et internationales ont demandé la collaboration et le soutien des membres de XF-ACTORS. XF-ACTORS a été le consortium leader dans cette urgence phytosanitaire avec d'intenses activités de réseautage à différents niveaux (international, national et régional).
Visibilité publique garantie et impact des résultats du projet : transfert de connaissances aux agences de l'UE (EFSA et Commission européenne) ; Partage des connaissances avec la communauté scientifique (plus de 100 articles évalués par des pairs publiés en libre accès) ; soutenir la sensibilisation des parties prenantes en publiant des synthèses de pratiques.
XF-ACTORS a été le premier projet de recherche international en Europe entièrement dédié au développement d'un programme de recherche multidisciplinaire sur la bactérie Xylella fastidiosa. Le consortium comprenait 30 partenaires et institutions de recherche, dont quatre centres de recherche non européens des États-Unis, du Brésil, du Costa Rica et de Taïwan, pays où la présence du pathogène est connue depuis longtemps.
Le projet visait à répondre au besoin urgent d’améliorer les stratégies de prévention, la détection précoce et le contrôle de Xylella fastidiosa en Europe. L’objectif général était de développer une stratégie globale pour la gestion intégrée des maladies graves associées à Xylella fastidiosa, afin de prévenir sa propagation ou son introduction dans les zones indemnes de Xf et d’atténuer son impact économique, environnemental et social.
Les connaissances générées par la recherche XF-ACTORS visaient à améliorer la capacité des agriculteurs à gérer la maladie et à prévenir de nouvelles pertes économiques dans les cultures ; Renforcer les capacités et les compétences des autorités phytosanitaires afin de consolider le régime phytosanitaire de l’UE ; et générer un impact positif sur l’amélioration des mesures de prévention de l’UE (dispositions législatives, procédures techniques, méthodes de contrôle des maladies, etc.). Les intérêts des parties prenantes ont été un facteur clé dans XF-ACTORS.
C'est pourquoi un programme intensif de sensibilisation et d'engagement des parties prenantes a été mis en œuvre, impliquant des représentants des services internationaux et nationaux de protection des végétaux et de quarantaine, des décideurs politiques de l'UE, des organisations de producteurs, des producteurs et des pépiniéristes, ainsi que des services de vulgarisation.
XF-ACTORS vise à établir un programme de recherche multidisciplinaire pour répondre au besoin urgent d’améliorer la prévention, la détection précoce et le contrôle de Xylella fastidiosa (Xf). Récemment, Xf a été introduit en Italie, où il cause de graves dommages aux cultures d'oliviers, et en France, où il est jusqu'à présent limité aux plantes ornementales et à certains arbres paysagers. L’objectif général du programme de recherche est d’évaluer le potentiel de Xf à s’étendre à l’ensemble de l’UE, tout en maximisant son impact grâce à une approche multifactorielle, basée sur une intégration transparente entre les 29 partenaires impliqués. Les actions proposées seront complémentaires à celles menées dans le cadre du projet POnTE - 635646, assurant ainsi une continuité ininterrompue avec les efforts actuellement en cours.
Des objectifs spécifiques ont été définis, suivant un cheminement étape par étape, depuis la prévention de leur introduction dans les zones indemnes de parasites jusqu’à l’établissement de stratégies d’éradication efficaces dans les zones infectées. Les mesures préventives contre Xf seront renforcées par la mise en œuvre de programmes de certification de l’UE et l’élaboration d’un plan visant à établir un réseau européen d’usines propres.
Les décideurs politiques de l’UE recevront un soutien grâce au développement d’outils d’évaluation des risques liés aux ravageurs, en se concentrant sur les épidémies actuelles et sur la prévision des régions potentiellement menacées. La surveillance sera mise en œuvre de manière appropriée, en soutenant le développement d’outils de détection précoce destinés à être utilisés sur le terrain, la technologie de télédétection et la modélisation prédictive. Des informations essentielles sur la biologie des agents pathogènes, les caractéristiques épidémiologiques et les hôtes menacés seront recueillies sous la direction de groupes de recherche américains possédant une longue expérience en recherche. Parallèlement, les interactions insectes-bactéries seront déterminées pour développer des mesures de contrôle stratégiques.
L’objectif global final est une stratégie globale de gestion intégrée des maladies associées au Xf, applicable à la fois aux systèmes de lutte intégrée et aux systèmes d’agriculture biologique, afin de prévenir la propagation du Xf et de contrôler son impact économique, environnemental et social en cas d’épidémie.
Des oliveraies historiques et une grande variété d’autres plantes sont menacées par un agent pathogène invasif hautement destructeur. XF-ACTORS a réuni des experts internationaux pour promouvoir des échanges fructueux et le développement des connaissances entre différents experts et disciplines, ce qui aidera les agriculteurs à contrôler le ravageur et à prévenir de nouvelles pertes économiques pour leurs cultures.
On pense que le pathogène végétal Xylella fastidiosa (Xf) est originaire d’Amérique centrale et est désormais présent dans le monde entier. La bactérie est transmise par des insectes qui se nourrissent de la sève des plantes et colonisent progressivement les tissus du xylème. Ceux-ci se bouchent, privant les plantes d’eau essentielle et les faisant mourir de soif de l’intérieur. Le pathogène est apparu pour la première fois en Europe en 2013 dans les Pouilles, en Italie, où le climat local a favorisé la propagation de la maladie, entraînant la destruction de millions d'oliviers, certains centenaires.
Depuis sa détection dans les Pouilles, différentes souches de la bactérie ont été identifiées dans le nord de l'Italie, en France, au Portugal et en Espagne. Les oliviers et les amandiers sont les cultures les plus menacées de l’UE. Le projet XF-ACTORS a établi un programme de recherche multidisciplinaire pour améliorer la prévention, la détection précoce et le contrôle du pathogène. « XF-ACTORS est le premier projet de recherche international en Europe entièrement dédié au développement d'un programme de recherche multidisciplinaire pour lutter contre Xylella fastidiosa, l'une des bactéries végétales les plus dangereuses au monde. « Le programme compte 29 partenaires de 14 pays, dont quatre centres de recherche non européens des États-Unis, du Brésil, du Costa Rica et de Taïwan », explique la coordinatrice du projet, Maria Saponari.
Le projet complète les travaux du projet POnTE, qui s’est efforcé de minimiser le risque d’introduction et l’impact des nouveaux parasites qui menacent l’agriculture et la foresterie de l’UE. Connaissez votre ennemi Grâce à l’utilisation à grande échelle du séquençage génomique, les chercheurs peuvent désormais faire la lumière sur l’origine du Xf en Europe, révélant que le pathogène a une histoire plus longue en Europe qu’on ne le croyait auparavant. « Nous savons maintenant que les souches présentent une diversité de gammes d'hôtes et d'agressivité, de sorte que les mesures visant à contrôler l'impact des infections doivent être adaptées aux scénarios spécifiques qui se produisent dans les différentes épidémies de l'UE en Italie, en France, au Portugal et en Espagne », explique Saponari.
Des progrès ont également été réalisés dans le déchiffrement des mécanismes et des composants du système immunitaire de l’hôte qui répondent à l’infection par Xf, ouvrant de nouvelles voies pour de futurs programmes de sélection et des approches de gestion durable à long terme. Les partenaires du projet ont également développé le plus grand ensemble de données de séquences génomiques, fournissant un outil unique pour répondre aux questions biologiques et épidémiologiques basées sur des analyses des relations phylogénétiques et des structures de population.
Des études en laboratoire et sur le terrain ont révélé quelles espèces de plantes les insectes vecteurs de l’UE préfèrent se nourrir, leur comportement alimentaire et à quel stade de leur cycle de vie ils sont devenus des porteurs efficaces de la bactérie. Une meilleure connaissance des insectes vecteurs implique des interventions plus ciblées pour réduire leur population et leur capacité à transmettre le virus Xf. Les chercheurs ont également créé des cartes de risques pour prédire la propagation du pathogène, leur permettant d’identifier les sites les plus vulnérables et de prioriser la surveillance. « Les données biologiques ont été utilisées pour affiner les paramètres des modèles épidémiologiques et garantir qu'ils représentent les scénarios de maladies du monde réel aussi précisément que possible », explique Saponari. La connaissance est un pouvoir. Trouver une solution définitive pour le traitement du Xf est un objectif ambitieux et à long terme. Grâce à XF-ACTORS, nous connaissons désormais plusieurs aspects de l’épidémie en Europe.
Les connaissances générées par la recherche XF-ACTORS aideront les agriculteurs à gérer le ravageur et à prévenir de nouvelles pertes économiques dans les cultures. « Cela comprend des outils visant à atténuer l'impact de la maladie, comme la réduction des populations de vecteurs ou l'amélioration de la résilience des plantes à l'infection. Cela renforcera également les capacités et l'expertise des autorités phytosanitaires afin de consolider le régime phytosanitaire de l'UE et d'améliorer les mesures préventives, telles que la législation, les procédures techniques et les mesures de lutte contre les maladies, entre autres », a déclaré Saponari.
Nous connaissons mieux notre ennemi : la grande campagne de séquençage génomique nous a fourni des informations scientifiques sur l’origine de Xylella en Europe, et nous savons que son histoire en Europe est en réalité plus longue que nous le pensions. Nous avons également élucidé certains aspects liés à son caractère exigeant ; Nous savons que certaines souches sont moins agressives que d’autres, les mesures visant à contrôler l’impact des infections doivent donc être adaptées aux scénarios spécifiques des différentes épidémies dans l’UE. Nous comprenons mieux comment les plantes contrecarrent les infections : des progrès ont été réalisés dans le déchiffrement des mécanismes et des composants du système immunitaire de l’hôte qui répondent à l’infection par Xylella, ouvrant de nouvelles voies pour de futurs programmes de sélection et des approches de gestion durable à long terme.
Nous savons mieux comment il interagit avec d’autres « cohabitants » dans les plantes ; Nous avons exploré les communautés microbiennes pour rechercher des foyers de résistance et des antagonistes naturels. Bien que les résultats n’aient pas encore identifié d’antagonistes positifs potentiels, l’analyse a fourni un aperçu de ce qui se passe dans les plantes infectées. Par exemple, nous avons montré que Xylella supprime d’autres microbes, devenant ainsi le micro-organisme prédominant dans la communauté microbienne. Nous connaissons mieux les insectes vecteurs européens : les recherches en laboratoire et sur le terrain ont révélé plusieurs caractéristiques des insectes vecteurs de l'UE (les espèces dont ils préfèrent se nourrir, leur cycle de vie, quand/à quel stade de leur cycle de vie ils sont devenus des porteurs efficaces de la bactérie de plante à plante, et leurs comportements alimentaires), permettant ainsi de mieux comprendre les mécanismes sous-jacents à l'acquisition et à la transmission de la bactérie.
En conclusion, une meilleure connaissance des insectes vecteurs signifie des interventions plus ciblées pour réduire leur population et leur capacité à transporter la bactérie, et donc un impact environnemental moindre pour la lutte antivectorielle. Nous avons développé des modèles pour prédire la propagation du pathogène, nous permettant d’identifier les sites les plus vulnérables pour prioriser les inspections. Nous avons introduit des innovations pour détecter les bactéries et, par conséquent, des outils pour améliorer le programme de surveillance.
- CONSIGLIO NAZIONALE DELLE RICERCHE (CNR)
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