Projet H2020 AGENT : activation du réseau GEnebank

AGENT vise à transformer les banques de gènes (GB) d'archives vivantes en centres de ressources bionumériques, équipés pour répondre aux besoins d'un monde en mutation. Quinze pôles génomiques de GB et quatre banques de gènes créeront un réseau pour travailler de manière exemplaire sur l'orge et le blé afin (i) d'établir un atlas européen (mondial) de la diversité génomique des cultures, (ii) d'activer des données phénotypiques héritées actuellement inaccessibles, (iii) de mettre en œuvre un nouveau concept d'accumulation concertée de données phénologiques et agronomiques pour des collections GenRes individuelles afin d'établir des ensembles de données de population de formation pour la prédiction à l'échelle du génome des accessions GenRes non testées.

Le phénotypage prendra en compte diverses conditions environnementales (climat, sol, géographie, pathogènes) fournies par la diversité des localisations écogéographiques des GB participants et de leurs partenaires. Ces activités seront soutenues par un réseau bioinformatique qui mettra en œuvre les principes, normes, protocoles et formats de données FAIR qui permettent le stockage, l'accès, l'utilisation et la réutilisation des données, étendant le portail EURISCO GenRes existant pour inclure de nouveaux types de données. AGENT utilisera les solutions existantes établies par les projets européens et les initiatives internationales en cours, mais développera également de nouveaux outils pour de nouvelles fonctionnalités d'accès, de visualisation et d'utilisation des données. Ceux-ci seront connectés et mis en œuvre via des plugins ou des services Web, permettant l'intégration dans EURISCO et d'autres portails de données, et une application facile à d'autres GenRes de cultures, sur la base de données déjà disponibles dans EURISCO ou fournies par le partenaire d'AGENT GB. Un réseau de tests coordonné est une autre couche unique d'AGENT, engageant directement les parties prenantes (par exemple, les coopératives agricoles, les sociétés de sélection, les ONG) dans le suivi, le mentorat, le renforcement des capacités et la formation au développement de flux de travail et d'outils.

Par conséquent, les résultats du projet AGENT seront diffusés directement à la Grande-Bretagne, aux chercheurs, aux éleveurs, aux décideurs politiques et au grand public, sensibilisant ainsi à l'importance sociétale générale et spécifique de GenRes.