Proyecto AGROALNEXT SOIL-HEALTH: Aplicación de metagenómica para la caracterización de suelos de distintos usos
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Description
Análisis de metabarcoding de muestras de suelo utilizadas para el cultivo de diferentes leguminosas y aplicación de nuevas técnicas de detección de microorganismos patógenos de suelo
Description contextuelle
El reto planteado fue conocer el impacto del manejo de cultivo orgánico (ecológico) y convencional en la microbiota asociada a la rizosfera de judía común (Phaseolus vulgaris L.) aplicando la técnica de metabarcoding en muestras de rizosfera provenientes de ambos sistemas de cultivo y se estudió la diversidad bacteriana (16S) y fúngica (ITS).
Résultats
Se detectaron diferencias en la rizosfera de judía según el manejo: el cultivo orgánico incrementó diversidad fúngica y taxones con funciones beneficiosas, mientras que el convencional favoreció la diversidad bacteriana. Estos resultados se presentaron en el XX Congreso Internacional Interacción Planta-Microorganismo.
Se desarrollaron, en colaboración con otro proyecto (INCREASE) 33 cebadores para identificar Colletotrichum, Pseudocercospora, Xanthomonas y Fusarium, optimizados mediante PCR convencional, mostrando un avance relevante en el diagnóstico molecular de patógenos.
Coordonnées
- Nombre coordinador/entidad: Ana María Campa
- Dirección postal: No disponible
- Email coordinador/entidad: anamaria.campanegrillo@asturias.org
- Teléfono: No disponible
Coordonnateurs
- SERIDA
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