Groupe opérationnel PURIBIOTIC : Caractérisation du profil de résistance aux antibiotiques du microbiote des lisiers pour la protection de l'environnement

Etude et caractérisation du profil bactérien digestif des élevages porcins et du rôle du lisier dans la dissémination de la résistance aux antibiotiques suite à son utilisation comme engrais sur les terres agricoles, pour la mise en œuvre de techniques de gestion du lisier favorisant la protection de l'environnement et de la santé publique.

• Etude du microbiote digestif des élevages porcins par phase de production et analyse de sensibilité à certains antibiotiques.
• Caractérisation de la résistance aux antibiotiques par phase de production.
• Analyse et corrélation du microbiote digestif et du profil de résistance aux antibiotiques dans le lisier des élevages étudiés.
• Détermination de la relation entre la propagation de la résistance aux antibiotiques et l’application de lisier comme engrais sur les terres agricoles.
• Analyse des facteurs de risque associés qui contribuent au développement et à la propagation de la résistance aux antibiotiques dans le microbiote du fumier.
• Développement de stratégies spécifiques pour réduire et contrôler la propagation de la résistance aux antimicrobiens par le lisier
• Développement de stratégies spécifiques pour minimiser l'impact de la résistance aux antimicrobiens sur les écosystèmes avec une approche One Health
• Etude des relations entre la résistance aux antibiotiques tout au long de la chaîne de gestion des lisiers.
• Élaboration de recommandations et de bonnes pratiques.
• Communication et diffusion,