Rizosfera Microbioma y resistencia a las enfermedades - Presentación del proyecto

La resistencia a las enfermedades no es una mera planta, sino un rasgo del sistema que involucra a la compleja comunidad microbiana asociada a la planta (Berendsen et al. 2012). Al igual que con los patógenos, la investigación pasada a menudo se centró en microbios simbióticos únicos y cultivables. Más recientemente, los cambios microbianos a nivel comunitario se han relacionado con la resistencia a las enfermedades. Sin embargo, las declaraciones simplistas como la "alta diversidad microbiana equivalen a plantas más saludables" no se confirmaron en los análisis de microbiomas más recientes (Hartmann et al. 2014, Yu et al. 2012). Las plantas tienen la capacidad de influir en la estructura microbiana en la rizosfera. Además del tipo de suelo, se ha demostrado que no solo diferentes especies de plantas, sino también diferentes genotipos dentro de la misma especie pueden modificar el microbioma de la rizosfera (por ejemplo, Berg et al. 2006, Peiffer et al. 2013). El objetivo general de nuestro proyecto es comprender las complejas interacciones del microbioma del genotipo X y hacer uso de este conocimiento en los programas de cría de resistencia. Para esto, investigaremos un fenómeno llamado fatiga del suelo del guisante, causada por un complejo de patógenos transmitidos por el suelo, y determinaremos los perfiles de microbioma de rizosfera de las líneas de guisantes con niveles contrastantes de resistencia a la enfermedad en diferentes suelos agrícolas utilizando NGS y QPCR. El objetivo es identificar centros microbianos, índices de diversidad y patógenos clave y beneficios involucrados en la resistencia a la enfermedad mediada por microbios. Esta información se vinculará con los perfiles de exudado de raíz para dilucidar la capacidad de la planta para influir en la composición del microbioma que conduce a la susceptibilidad o resistencia de la enfermedad. A largo plazo, las actividades de investigación actuales y futuras de nuestro grupo tienen como objetivo hacer uso de las interacciones vegetales-microbios en el reproducción de plantas para una expresión y estabilidad mejoradas de rasgos importantes de las plantas.