Projet H2020 CLIMIFUN : Contrôle climatique et temporel de la diversité microbienne et du fonctionnement des écosystèmes : perspectives d'un nouveau modèle conceptuel
- Taper Projet
- Statut Rempli
- Exécution 2016 -2019
- Budget alloué 239.191,2 €
- Portée Europeo
- Communauté autonome Madrid, Comunidad de
- Principale source de financement Horizon 2020
- Site Web du projet https://mdelgado-baquerizo.weebly.com/marie-curie-project.html
CLIMIFUN a permis de réaliser le premier atlas mondial des taxons bactériens dominants. Nous démontrons ici que seulement 2 % des phylotypes bactériens (environ 500 phylotypes) représentent systématiquement près de la moitié des communautés bactériennes du sol dans le monde. Malgré l'immense diversité des communautés bactériennes, relativement peu de taxons bactériens sont abondants dans les sols à l'échelle mondiale. Nous avons regroupé ces taxons dominants en groupes écologiques afin de construire le premier atlas mondial des taxons bactériens du sol, publié dans la revue Science en janvier (Delgado-Baquerizo et al. 2018. Ciencia 359 : 320–325).
Une avancée importante de cette étude réside dans le fait que les préférences en matière d'habitat ne sont pas prévisibles uniquement à partir de l'identité au niveau du phylum, étant donné que tous les groupes écologiques comprenaient des phylotypes de plusieurs phylums. En réduisant le nombre de phylotypes ciblés par les études futures de quelques dizaines de milliers à quelques centaines, notre étude ouvre la voie à une meilleure compréhension prédictive des communautés bactériennes du sol, essentielle pour prédire avec précision les conséquences écologiques des changements environnementaux mondiaux en cours. CLIMIFUN a étudié l'évolution de la biodiversité des sols au cours du développement des écosystèmes (PNAS, 2019).
Les changements dans la biodiversité souterraine au cours de la pédogenèse ont suivi deux schémas principaux. Dans les écosystèmes à faible productivité (plus secs et plus frais), l'augmentation de la biodiversité souterraine a suivi l'augmentation du couvert végétal. Dans les écosystèmes plus productifs (plus humides et plus chauds), l'acidification accrue au cours de la pédogenèse a été associée à une diminution de la biodiversité souterraine. Les changements dans la diversité des bactéries, des champignons, des protistes et des invertébrés avec la pédogenèse étaient fortement et positivement corrélés à l'échelle mondiale, soulignant que la biodiversité souterraine partage des facteurs écologiques similaires à mesure que les sols et les écosystèmes se développent. Ensemble, nos résultats démontrent que les schémas écologiques de la biodiversité souterraine sont prévisibles pour les principaux types d'écosystèmes répartis à l'échelle mondiale et suggèrent que les changements dans le couvert végétal et l'acidification des sols au cours du développement des écosystèmes sont associés à des changements de la biodiversité souterraine sur des siècles, voire des millénaires. CLIMIFUN a également fourni la première évaluation mondiale des facteurs environnementaux contrôlant l'effet d'amorçage (Nature Communications, 2019). Nos travaux ont montré que l’ampleur de l’effet d’amorçage positif apparent (augmentation de la libération de CO2 par le renouvellement accéléré de la biomasse microbienne) était négativement associée à la teneur en SOC et aux taux de respiration microbienne.
Français Notre modèle statistique suggère que les effets d'amorçage apparents ont tendance à être négatifs sur les sites plus mésiques associés à des teneurs en SOC plus élevées. En revanche, un seul apport de C labile provoque des effets d'amorçage apparents positifs dans les zones plus arides à faible teneur en SOC. Nos résultats fournissent des preuves solides que la teneur en SOC joue un rôle essentiel dans la régulation des effets d'amorçage apparents, avec des implications importantes pour l'amélioration des modèles de cycle du C dans les scénarios de changement global. CLIMIFUN a également étudié l'importance des communautés microbiennes comme prédicteurs de la résilience multifonctionnelle (cycles du C, de l'N et du P) au changement climatique et à la fertilisation azotée. Ces travaux ont été publiés dans Ecology Letters en septembre 2017 (Delgado-Baquerizo et al. 2017. Ecology Letters 20 : 1295–1305).
Malgré l’importance des communautés microbiennes du sol pour le fonctionnement des écosystèmes et le bien-être humain, on sait peu de choses sur les mécanismes qui contrôlent la composition et la diversité de ces communautés, ainsi que sur le rôle de leurs attributs dans la fourniture de multiples fonctions et services écosystémiques, tels que le cycle des nutriments et la décomposition (c’est-à-dire la multifonctionnalité).
De nombreuses études ont identifié le climat, le stade de développement des écosystèmes et les caractéristiques des sols comme des facteurs majeurs de la diversité végétale et animale. Cependant, on en sait beaucoup moins sur les effets interactifs du climat, des propriétés des sols et du temps sur le contrôle de la diversité microbienne et de la multifonctionnalité au cours de la succession écosystémique. Ce manque de connaissances entrave notre capacité à prédire l'évolution des communautés microbiennes et leurs conséquences sur le fonctionnement des écosystèmes dans le contexte du changement climatique, et limite l'inclusion des microbes du sol dans les modèles biogéochimiques mondiaux.
L'objectif principal de cette action est d'approfondir l'étude des modèles et mécanismes qui influencent la diversité microbienne et la multifonctionnalité des sols dans des environnements en mutation. Nous utiliserons un cadre conceptuel innovant combinant chronoséquences à long terme, expériences sur le changement climatique et modélisation par équations structurelles pour évaluer quantitativement le rôle du temps, du climat et de multiples facteurs du sol dans le contrôle de la diversité microbienne et de la multifonctionnalité.
Les recherches décrites dans ce projet incluent un ensemble de méthodes biochimiques, moléculaires et génomiques de pointe pour l'analyse des communautés microbiennes et de leur multifonctionnalité, garantissant ainsi une utilité et un impact maximaux de nos résultats. Ensemble, CLIMIFUN révélera les facteurs contrôlant la diversité microbienne du sol et les multiples fonctions liées à la production végétale et au cycle des nutriments dans un environnement en mutation. Ces travaux combleront ainsi une lacune essentielle dans les connaissances pour répondre à la demande mondiale croissante en aliments et en fibres au cours des prochaines décennies et constituent une priorité de recherche pour Horizon 2020.
De nombreuses études ont identifié le climat, le stade de développement des écosystèmes et les caractéristiques des sols comme des facteurs majeurs de la diversité végétale et animale. Cependant, on en sait beaucoup moins sur les effets interactifs du climat, des propriétés des sols et du temps sur le contrôle de la diversité microbienne et de la multifonctionnalité au cours de la succession écosystémique. Ce manque de connaissances scientifiques entrave la capacité des scientifiques à prédire les changements au sein des communautés microbiennes et leurs conséquences sur le fonctionnement des écosystèmes dans le contexte du changement climatique. Il limite également l'inclusion des microbes du sol dans les modèles biogéochimiques mondiaux.
Le projet CLIMIFUN a comblé ce manque de connaissances en étudiant les schémas et mécanismes mondiaux qui régissent la diversité microbienne des sols et les processus écosystémiques dans des environnements en mutation. « En menant des expériences et des études de terrain à l'échelle mondiale, nous avons approfondi notre compréhension des principaux schémas et mécanismes mondiaux au sein des biomes et lors de la formation des sols », explique Manuel Delgado-Baquerizo, chercheur Marie Skłodowska-Curie. Une initiative internationale. Des scientifiques de plus de 30 institutions ont mené une enquête mondiale, collectant des données de terrain dans neuf pays et six continents. « Le plus grand défi consistait à élaborer des protocoles standardisés pour les relevés de la végétation et les études d'environnements divers, tels que les écosystèmes arides et les forêts tropicales, qui soient faciles à suivre par tous les types de chercheurs, des écologues de terrain aux biologistes moléculaires », explique Delgado-Baquerizo. Ces résultats révolutionnaires ont révélé l'évolution de la biodiversité des sols au cours de millions d'années de développement des écosystèmes et ont contribué à la création du premier atlas mondial de la biodiversité des sols (ouvre dans une nouvelle fenêtre). « Étant donné que le rôle du temps dans le contrôle de la distribution des organismes du sol reste largement inexploré, en particulier à l’échelle mondiale, CLIMIFUN constitue une étude pionnière dans ce domaine », déclare Delgado-Baquerizo.
Le projet apporte également de nouvelles preuves que la biodiversité des sols contrôle les réponses des fonctions écosystémiques aux facteurs du changement global (ouvre une nouvelle fenêtre). De plus, il a identifié, pour la première fois, le rôle des climats passés dans le contrôle de la répartition de la biodiversité des sols à l'échelle mondiale (ouvre une nouvelle fenêtre). De plus, CLIMIFUN a identifié les endroits sur Terre où des taxons inconnus devraient être découverts et caractérisés dans les années à venir. CLIMIFUN fournit des informations essentielles sur l'histoire naturelle de la biodiversité des bactéries, champignons, protistes et invertébrés du sol dans les écosystèmes terrestres des principaux biomes du monde. Selon Delgado-Baquerizo : « Nos travaux ont montré qu'à mesure que le sol se développe, les changements dans sa biodiversité sont induits par les variations de la couverture végétale et l'acidification au fil des millénaires. » L'initiative a également apporté un éclairage fondamental sur le rôle de la biodiversité des sols dans le soutien du fonctionnement des écosystèmes, de la fertilité à la production végétale, et dans la réponse des fonctions écosystémiques au changement global. Elle a également quantifié l'importance de la mémoire écologique dans le contrôle des fonctions écosystémiques et de la biodiversité des sols à l'échelle mondiale.
Les connaissances issues de CLIMIFUN bénéficieront aux scientifiques, aux écologistes, aux gestionnaires des terres, aux enseignants et aux décideurs politiques. « L'atlas mondial, par exemple, fournit des informations de base pour l'enseignement de la répartition mondiale des organismes du sol, comme c'est le cas pour les plantes depuis des décennies. Il comprend également des informations sur les sites à protéger pour préserver la biodiversité des sols à l'échelle mondiale. De plus, il pose d'importants défis et axes de recherche pour les chercheurs qui cherchent à identifier les taxons dominants dans les sols du monde entier », conclut Delgado-Baquerizo.
- UNIVERSIDAD REY JUAN CARLOS
- REGENTS OF THE UNIVERSITY OF COLORADO
- Site Web du projet (CORDIS)
- Fiche d'information du projet CORDIS (pdf)
- Gazouillement
- Actualités (Ciencia.es)
- Actualités (ABC)
- Actualités (El País)
- Actualités (OPB.ORG)
- Actualités (NPR.ORG)
- Divulgation des résultats
- Divulgation chez Zenodo
- Site Web de l'Université Rey Juan Carlos
- Site Web des RÉGENTS DE L'UNIVERSITÉ DU COLORADO