H2020 INCREASE Proiektua: Europako nekazaritza-elikagai sistemetarako elikagai-lekaleen baliabide genetikoen bilduma adimendunak

Mota Proiektua
Egoera Firmado
Exekuzioa 2020 -2026
Esleitutako Aurrekontua 6.999.999,5 €
Eremua Europeo
Finantza-iturri nagusia Horizonte 2020
Proiektuaren webgunea Proyecto INCREASE

Azalpena

Lekaleak funtsezkoak dira iraunkortasunerako, elikagaien segurtasunerako eta giza osasunerako, Europako proteina-laboreen ekoizpenean berrikuntzarako Europako Proteina Estrategia berriaren arabera. EBk finantzatutako INCREASE proiektuak lekaleen baliabide genetikoen kudeaketa eta erabilera hobetuko ditu. Erronka horri aurre egiteko, erabilera zabalduko du, erabiltzaileen beharrak asetuz, eskuragarri dagoen informazioaren irisgarritasunari, kalitateari eta kantitateari dagokienez.

Proiektuak lau lekale nagusitan zentratuko da: txitxirioak, babarrun arruntak, dilistak eta lupinoak. Laburbilduz, INCREASEk Europa indartuko du lekaleen baliabide genetikoen arloan eta, aldi berean, laboreen baliabide genetiko guztientzat eredu eta tresna garrantzitsua izango da.

Jardueren deskribapena

GenRes-en sarbideak INCREASE bazkideengandik bildu ziren, datu-multzoak modu esklusiboan identifikatzeko bereziki garatutako txantiloi-fitxategi bat erabiliz. INCREASE kode eta DOI kode bakar bana esleitu zitzaizkion sartze bakoitzari.
Fenotipaketa protokoloak ezarri ziren espezie bakoitzerako eta bazkide guztien eskura jarri ziren GenRes karakterizatzeko SSD garapenean, ondorengo hazien hazkuntza zikloetan eta baldintza kontrolatuetan egindako landa-esperimentuetan. Hazien Hazkunde Primarioan zehar baldintza kontrolatuetan hazitako haziak eta landareak fenotipatzeko protokoloak lau argitalpen zientifikotan deskribatu ziren Current Protocols in Plant Biology aldizkarian (DOI: 10.1002/cpz1.133; 10.1002/cpz1.134; 10.1002/cpz1.191; 10.1002/cpz1.371). Fenotipaketa molekularrari dagokionez, transkriptomika eta metabolomika protokoloak optimizatu eta ezarri dira lau laboreetarako. DNA erauzketa kanalak ezarri dira, eta T-COREetarako DNA erauzketa amaitu da, eta R-COREetarako martxan dago une honetan. ADN zaharra (DNA zaharra) erauzteko protokolo bat arrakastaz probatu da Parisko Historia Naturalaren Museo Nazionaletik lortutako babarrun arruntaren herbario-lagin historiko batean, eta Illumina WGS erabiliz sekuentziatu da. Protokoloa erabili da lekale taxon desberdinetako 67 herbarioko laginetatik DNAa arrakastaz ateratzeko, eta horren sekuentziazioa martxan dago. Genoma osoaren sekuentziazio eta genotipaziorako, kalitate handiko genomaren muntaketarako eta pangenomaren berreraikuntzarako bide guztiak ezarri eta probatu ziren. Lehen babarrun arruntaren pangenoma bat osatu da, eta lorpen hori deskribatzen duen eskuizkribua bidaltzeko prest dago. Lentiletan genoma handiak genotipatzeko teknika berri bat garatu eta arrakastaz probatu da, eta teknika horren garapena deskribatzen duen artikulu bat argitaratu da Genome Research aldizkarian (DOI: 10.1101/gr.277628.122).
GenRes-en bildutako datuak, ahizpa-proiektuetatik eskuragarri dauden pasaporte-datu, fenotipoak eta genotipoak barne, erabiltzen dira R-CORE, T-CORE eta H-CORE ezartzeko. Hainbat hazi-hazkuntza ziklo egin ziren, hazi heterogeneoekin eta SSDekin hasita, eta haziak beren jarduerekin lotutako bazkide guztiei banatu zitzaizkien. R-CORE eta T-CORE lerroen azpimultzoak erabili ziren baldintza kontrolatuetan, hala nola ur-estresean, babarrun arruntarentzat eta txitxirioarentzat, eta artoaren eta babarrun arruntaren tartekatze lanetarako, fenotipoaren karakterizaziorako. Hainbat landa-ensegu egin ziren lau espezieentzat, eta horietan garatutako fenotipazio-protokolo arruntak erabili ziren. Transkriptomiko eta metabolomiko ikerketarako bildutako 16.000 lagin baino gehiagotatik, metabolitoen profilaketa GC-MS eta/edo LC-MS erabiliz egin zen 7.500 laginetan. Gaur arte, babarrun eta txitxirio lerro arruntetako 1.200 hosto RNA lagin erauzi eta sekuentziaziorako bidali dira. Nutrizio- eta teknologia-analisiak ere egiten ari dira. INCREASE-k germoplasma kontserbatzeko ikuspegi guztiz deszentralizatua diseinatu eta probatu zuen, 1.126 SSD babarrun lerro arrunt banatuz Europan zehar publikoki lantzeko eta karakterizatzeko. Herritarren Zientzia Esperimentuaren lehen txandaren arrakastaren ondoren, beste bi txanda jarri ziren martxan 2022an eta 2023an, guztira 16.000 Europako herritarren erregistro baino gehiago lortuz. Proiektua hasi zenetik, Herritarren Zientzia aplikazio pertsonalizatu bat garatu eta hobetu da, datuak biltzea eta Easy-STMA akordioen prozesamendua erraztuz, parte-hartzaileen arteko hazien trukea bermatuz esparru juridiko baten barruan. Aplikazio berritzaile honek etorkizuneko Herritarren Zientzia proiektuen oinarriak ezartzen ditu RFAArekin lotutakoak.

Testuinguruko deskribapena

Elikagai-lekaleak funtsezkoak dira nekazaritzari lotutako gizarte-erronka guztietarako, besteak beste, klima-aldaketaren arintzea, agrobiodibertsitatearen kontserbazioa, nekazaritza jasangarria, elikagaien segurtasuna eta giza osasuna. Zentzu honetan, alderdi gako bat landare-oinarritutako dietetara trantsizioa da, batez ere lekale dietetikoetan oinarrituta.

Elikagai-lekadunen baliabide genetikoen (GenRes) karakterizazioa, mantentzea eta ustiapena, gaur egun arte neurri handi batean ustiatu gabeak, nekazaritza jasangarria eta elikadura-sistema osasungarriak garatzeko oinarria dira. INCREASE proiektuak, txitxirioan, babarrun arruntean, dilistetan eta lupinuan arreta jarriz, GenRes kontserbatzeko, kudeatzeko eta karakterizatzeko ikuspegi berritzaile bat ezartzen ari da. Bilduma Adimendunak garatzen ari dira, hazi bakarreko ondorengo purifikatuen (SSD) bilduma nagusiek osatua, gene-bankuetatik eta ustiategietatik eskuragarri dagoen germo-plasma ustiatzen dutenak, eta karakterizazio genotipiko eta fenotipiko maila desberdinen menpe daudenak.

Fenotipaketa eta geneen aurkikuntza jarduerek, parte-hartze ikuspegi baten bidez, hainbat eragileren (hazleak, zientzialariak, nekazariak, nekazaritzako elikagaien industriak eta elikagaiez kanpoko industriak) beharrei erantzungo diete, metabolomika eta transkriptomika masiboen, adimen artifizialaren eta tresna adimendunen indarra aprobetxatuz. Horrez gain, INCREASEk, Herritarren Zientzia Esperimentu (CSE) baten bidez, GenRes-en kontserbazio eta erabilera deszentralizatu eta dinamikorako sistema berritzaile bat probatzen ari da. Elikagai-lekaleen erabilera sustatuz, kalitatea, egokitzapena eta errendimendua hobetuz, eta nekazaritza- eta elikagai-sektorearen lehiakortasuna bultzatuz, INCREASEk eragin handia du ekonomian eta gizartean, GenRes laboreen kontserbazio eta ustiapenerako ikuspegi integratzaile eta parte-hartzaileen kasu-azterketa bat izanik. HANDITU-k honako hau du helburu:

Hobetu elikagai-lekaleei buruzko GenRes datuen kudeaketa eta partekatzea datu-base sinplifikatuen eta erraz eskuragarri dauden tresnen bidez.
Kalitate handiko datu genotipiko eta fenotipiko kopuru handia sortzea.
GenRes aniztasuna aztertzeko Bilduma Adimendunak garatu eta kontserbazio-kudeaketa ikuspegi berritzaileak elkarlanean diseinatzeko.
Sortu ezagutza berria, web bidezko bilaketa eta bistaratze tresnen bidez erraz eskuragarri dagoena, germoplasma iturri egokiak identifikatzeko.
GenRes kudeaketa dinamikorako jardunbide egokienak garatu, probatu eta zabaldu mundu osoko erakunde eta ekimenetan.
Datuak partekatzeko eta germen-plasma kontserbatzeko informazio-teknologia deszentralizatuko ikuspegiak garatzea.

Helburuak

INCREASEk elikagai-lekadunen baliabide genetikoen kudeaketa eta erabilera hobetuko ditu, eta hauek funtsezkoak dira iraunkortasunerako, elikagaien segurtasunerako eta giza osasunerako, sektore honetako berrikuntzarako Europako Proteina Plan berriak aitortzen duen bezala. Erronka honi aurre egiteko, INCREASEk elikagai-lekadunen baliabide genetikoen erabilera zabalduko du, erabiltzaileen beharretan arreta jarriz, eskuragarri dagoen informazioaren irisgarritasunari, kalitateari eta kantitateari dagokionez.

INCREASE, EBko nekazaritzarako eta elikagaien industriarako berrikuntza-balio handia duten lau lekale garrantzitsurekin (txitxirioak, babarrun arruntak, dilistak eta lupinoak) lan egiten duena, lau zutabe hauetan oinarrituko da:

Datuak kudeatzeko irtenbide berritzaileak, datuak trukatzeko eta azpiegitura nagusietan integratzeko erreferentziazko estandarrak garatzeko, datu-sarrera deszentralizatua, metodologia definituak eta informazio berria ustiatzeko jardunbide egokiekin, baita erabiltzeko errazak diren bistaratze-tresnen garapenarekin ere.
Germoi-plasmaren kudeaketarako tresna eta printzipio berrien garapena, "Bilduma Adimendunen" garapenean oinarrituta, labore bakoitzaren aniztasun osoa ordezkatzen duten tamaina desberdineko oinarrizko bilduma multzo gisa.
Genotipazio eta fenotipazio teknologia aurreratuen adopzioa, erabiltzaileentzako interesgarriak diren ezaugarrietan zentratutako Adimen Artifizialaren potentzialarekin konbinatuta.
INCREASEren irismena eta anbizioa zabaltzeko, Europako erabiltzaileentzako eskuragarri dauden datuen eta baliabide genetikoen integrazioa erraztuz, Europako bazkide ez-europarrak eta nazioarteko erakundeak parte hartzen duten nazioarteko ahalegin bat egiten ari da. Herritarren zientziako esperimentu bat garatuko dugu, batez ere proiektua interesdunen eta herritarren artean zabaltzeko helburuarekin.

Oro har, INCREASEk Europa indartuko du lekaleen baliabide genetikoen arloan eta, aldi berean, laboreen baliabide genetiko guztientzat eredu eta tresna garrantzitsua izango da.

Informazio gehigarria

GenRes-en egoera hobetzea eta kontserbazio-ahaleginen eraginkortasuna handitzea, batez ere Europan; GenRes kudeaketarako kalitate handiko estandar harmonizatuak Europa osoan (eta haratago).
GenRes laboreetarako ezarritako informazio-sistemetan datuen kantitatea eta kalitatea handitzea.
Europako eta beste leku batzuetako gene-bankuen/in situ kontserbazio-guneen artean baliabideak eta zerbitzuak partekatzeko modu berritzaileak.
Zerbitzu berriak kontserbazio-komunitateen barruan eta kanpoan dauden erabiltzaileentzat.
Eragin ekonomiko eta sozialak lekaleen kalitatea, egokitzapena eta errendimendua hobetuz, Europako nekazaritza eta elikagai sektoreen lehiakortasuna bultzatuz, Europako Landare Proteinen Planaren gomendio berriekin bat etorriz, eta GenRes lekaleen erabilera sustatuz.
Barietate berriak agroekosisteman elikagai-lekaleak errazago txertatzeko, agrobiodibertsitatea hobetuz, horrek dakartzan ondorio positibo guztiekin (adibidez, jasangarritasuna, elikagaien segurtasuna, etekin ekonomikoak, produktuen dibertsifikazioa, giza elikadura hobetzea).
Elikagai-lekaleen ingurumen-egokitzapena Europako inguruneetara eta klima-aldaketara, txitxirioen eta babarrun arruntaren lehorte-tolerantzia hobetua barne.

Koordinatzaileak

UNIVERSITA POLITECNICA DELLE MARCHE (UNIVPM)

Otros links

H2020 INCREASE Proiektua: Europako nekazaritza-elikagai sistemetarako elikagai-lekaleen baliabide genetikoen bilduma adimendunak

Lotutako proiektuak