Proyecto H2020 BovReg:BovReg: identificación de características genómicas funcionalmente activas relevantes para la diversidad fenotípica y la plasticidad en el ganado vacuno

Enfoques genómicos para una mejor cría del ganado Comprender los mecanismos biológicos detrás de las variaciones genéticas podría ayudar a los agricultores a criar ganado de manera eficiente y mejorar el bienestar animal. La información genómica (los datos celulares que un organismo necesita para crecer y funcionar) se ha analizado y utilizado durante un tiempo para criar ganado más resistente y sano. Una desventaja clave es que los mecanismos biológicos que subyacen a ciertas variantes genéticas aún no se comprenden ampliamente. 

Por lo tanto, las consecuencias para la salud y el bienestar del ganado pueden ser impredecibles, ya que ciertos rasgos genéticos pueden tener efectos secundarios imprevistos. El proyecto BovReg buscó avanzar hacia un enfoque más basado en la biología, donde se comprende mejor la función de una variante genética específica. "Esta sigue siendo un área muy desconocida", afirma Christa Kuehn, coordinadora del proyecto BovReg, actualmente en el Instituto Friedrich-Loeffler de Alemania. "Sin embargo, sabemos que más del 95 % del genoma que no se traduce en proteínas debe tener alguna función; de lo contrario, la evolución no lo habría mantenido durante millones de años". Investigación de las regiones reguladoras del genoma Kuehn y sus colegas querían investigar estas regiones reguladoras del genoma. Para descubrir estos mecanismos, el proyecto, coordinado por el Instituto de Investigación de Biología de Animales de Granja en Alemania, generó enormes cantidades de datos genómicos funcionales compartidos a partir de tejido bovino y líneas celulares de uso frecuente. El objetivo era establecer un conocimiento mucho más detallado de los rasgos relacionados con la robustez y la salud del ganado. 

Para ello, el proyecto también desarrolló canales bioinformáticos para garantizar que el análisis de datos fuera reproducible e interoperable en diferentes plataformas. "Se generó una enorme cantidad de datos, también utilizables para la investigación biomédica", explica Kuehn. "Queríamos asegurarnos de que esta información fuera utilizable y accesible". Todos los datos se incorporarán a un portal público global de datos . "También realizamos un mapeo ético para representar gráficamente las percepciones sociales sobre la reproducción genómica", añade Kuehn. "La investigación a veces puede causar disrupción social o reticencia, por lo que queríamos anticiparnos y analizar sus posibles implicaciones para la sociedad". Anotación funcional de genomas animales Los resultados del proyecto BovReg también han alimentado el proyecto global FAANG (Anotación Funcional de Genomas Animales), una organización que reúne la investigación genómica en animales de granja en todo el mundo. La comunidad FAANG está operando en paralelo con la iniciativa ENCODE . Esta se dedica a caracterizar la función del genoma humano. BovReg co-creó EuroFAANG, una iniciativa paraguas de seis proyectos relacionados financiados por la UE, que han acordado canales de datos comunes y protocolos generales, asegurando que el conocimiento se difunda lo más ampliamente posible. 

Construyendo sobre este paraguas EuroFAANG, más financiación de la UE se aseguró hace 2 años para un proyecto llamado EuroFAANG Research Infrastructure , que establecerá la infraestructura necesaria para continuar esta cooperación en el futuro. "Uno de los principales desafíos después de un proyecto como BovReg es mantener a las personas unidas y asegurar que la comunidad continúe", dice Kuehn. Mejorar las prácticas de cría de ganado Kuehn y su equipo creen que el trabajo pionero del proyecto BovReg ayudará a mejorar las prácticas de cría. «Cuanto más sepamos sobre la función genómica, más podremos evitar los efectos secundarios perjudiciales de la cría», señala. «Esto podría ahorrar recursos y mejorar el bienestar animal». Una mejor información genómica también podría conducir a un manejo animal y una intervención veterinaria más específicos. «Algunas poblaciones animales podrían beneficiarse más de un tratamiento personalizado que otras», añade Kuehn. «Avanzar en la comprensión de las funciones genómicas puede ayudarnos a comprender las necesidades reales de los animales».