H2020 SMARTER Proiektua: Hausnarkari txikien hobekuntza genetikoa eraginkortasuna eta erresilientzia lortzeko

Zazpi populazio esperimental (9 arraza: 1 ahuntz, 4 esne-ardi eta 4 haragi-ardi) ezarri eta sakon aztertu ziren elikadura-eraginkortasuna (FE) zehazteko. Ezaugarri fenotipikoen zerrenda batek (>=30) EFrekin erlazioa erakutsi zuen. Aztertutako biomarkatzaileen artean, odol-metabolitoak eta esnearen gantz-azidoen profila nabarmendu ziren itxaropentsuenak. Gainera, hautagaien fenotipoen zerrenda bat zehaztu zen adierazle posible gisa, besteak beste, pisu bizia, bizkarreko koipea, muskulu-sakonera, esne-koipea, proteina eta laktosa edukia, gorputz-egoeraren puntuazioa (BCS), elikadura-kontsumoa, elikadura-portaera, errumenaren lipidoma eta errumenaren mikrobiota eta Pac Chambers GEI. EF ezaugarri horietarako, SMARTER-ek heredagarritasuna, ekoizpenarekin eta GEI ezaugarriekin korrelazioa eta emaitza genomiko batzuk eman zituen. Erresilientzia (R) ezaugarritzeko, fenotipo berriak bildu ziren, besteak beste, oinetako usteldura, mastitisa, gastrointestinal (GIN) parasitoak, biziraupena eta iraupena, amaren gaitasuna eta portaeraren erreaktibotasun ezaugarriak. Fenotipo berriak aztertu dira, hala nola, immunitatearekin, errumina-tenperaturarekin, estres metabolikoarekin, bero-estresarekiko tolerantziarekin, BC-ko aldaketak eta GPSak sortutako fenotipoekin lotutako ezaugarriak.

Ezaugarri hauentzako parametro genetiko asko eskaintzen ditugu eta GIN (ardiak eta ahuntzak), oinen usteldura eta mastitis (ardiak) eta iraupenaren (ahuntza) ugaltzeko lehen balioak ematen ditugu. Azterketa genomikoak egin ziren ezaugarri horietako 11rentzat zazpi arrazatan, erresilientzia kontrolatzen duten geneak eta mekanismoak hobeto ulertzeko. I+Eren arteko lotura genetikoa aztertu zen lehendik zeuden datuak, datu berriak eta eredu esperimental eta genomikoak erabiliz. Lehenik eta behin, metaanalisi integral bat osatu zen, I+E ezaugarrien arteko merkataritza-off batzuk identifikatu zituena. Azterketa genomikoak erabili ziren bi R&E ezaugarriekin lotutako loci pleiotropikoak identifikatu eta karakterizatzeko. Lau hautaketa-esperimentu ardietan eta bat ahuntzetan aztertu ziren I+E ezaugarrien arteko truke-off horren azpian dauden mekanismoak aztertzeko. Aurkikuntza nagusiak hauek izan ziren: I+Erako hautaketaren eta erresilientzia-mekanismo eta fenotipo gako batzuen arteko truke-off garrantzitsuen froga gutxi, eta erronken aurrean erresilientzia-ibilbideak aztertzeko metodo eta adierazle berriak. Datu esperimentalak baliabideak esleitzeko ereduak egokitzeko eta kalibratzeko ere erabili ziren, erronkei eta hainbat hazkuntza estrategiari erantzunak aurreikusteko.

Ereduak immunitateak kostu energetikoa duela dioen lehen froga enpiriko "benetakoa" eman zuen. Hausnarkari txikien aniztasun genetikoa ezaugarritzeko, arraza erresistenteak eta gutxi erabiliak barne, SMARTERek 285 ardi eta 166 ahuntz populazioren (17.000 animalia) datu genetikoak eta ingurumenari dagozkion eta sortu berri diren biltegi komun bat sortu zuen. Populazioen azterketa metodo estandarrak erabiliz, baita geneen anotazio historikoari eskainitako estatistika-metodo berri bat erabiliz, SMARTERek hausnarkari txikien populazioen arteko erlazio genetikoak ezaugarritu zituen eta haien egokitzapen bioklimatikoan parte hartzen duten eskualde genomikoak identifikatu zituen. Ardi eta ahuntzetan I+E ezaugarriak aztertzeko eta hautatzeko metodoak garatu edo egokitu ziren. Ingurugiro-estresa eta erresilientziari lotutako ezaugarriak detektatzeko eta aztertzeko, SMARTERek hainbat ikuspegi erabili zituen (bariantzen gaineko nahasketa-eredua, erresilientzia erreakzio-eredu normal batean, xede-ibilbideetatik desbideratzearen adierazle estatistikoak). Era berean, arraza txikien barruan eta arraza txikien artean iragarpen genomikoak hobetu eta ebaluatzeko metodoak garatu ziren, ingurune anitzetan hautaketa programa onak bermatzeko edo genotipatzeko estrategia anitzak dituztenak, eta aniztasun genetikoa eta anomalia recesiboak ebaluatzeko eta kudeatzeko.

Nazioarteko lankidetza indartuz I+E ezaugarrien hautaketaren eraginkortasuna hobetzeko helburuarekin, SMARTERek nazioarteko ebaluazio genetikoa egiteko beharrezko baldintzak eta tresnak sortu zituen. Nazioz gaindiko lehen ebaluazio genetikoak hausnarkari txikietan egin ziren, eta onura tekniko eta ekonomikoak frogatu zituzten. Bien bitartean, SMARTERek prozesu-fluxu bat garatu zuen ohiko ebaluazio genetikoetarako eta herrialdeek ebaluazio horietan duten interesa ebaluatu zuen.

Eskala handiko 31 I+E fenotipatzeari buruzko gomendioak garatu ziren, eta ondorioz ICAR-erako jarraibideak sortu ziren. Ardi populazioetan genotipoen informazio panel bat garatu zen eta eskuragarri dago SMARTER webgunean. Hazkuntzak ustiategietan eta populazio-mailan dituen eragin agroekologikoei buruzko ikerketen emaitzek frogatu zuten: aukera handiak daudela balioa sortzeko I+E ezaugarrien hobekuntza genetikoari esker; Abeltzainek argi ikusten dute animalien erresilientzia eta eraginkortasunaren beharra nekazaritza-sistema sendo eta etorkizunekoetan; eta ekoizpenaren eta I+G ezaugarrien artean nahi den hautapen-oreka lortzen duten hazkuntza-helburuak ezartzeko aukera dago. Ardi populazioetan genotipoen panel informatiboa garatu zen eta eskuragarri dago SMARTER webgunean. Hazkuntzak ustiategietan eta populazio-mailan dituen eragin agroekologikoei buruzko ikerketen emaitzek frogatu zuten: aukera handiak daudela balioa sortzeko I+E ezaugarrien hobekuntza genetikoari esker; ii) abeltzainek argi ikusten dute animalien erresilientzia eta eraginkortasunaren beharra nekazaritza-sistema sendo eta etorkizunekoetan; eta ekoizpenaren eta I+G ezaugarrien artean nahi den hautapen-oreka lortzen duten hazkuntza-helburuak ezartzeko aukera dago.

Ardi populazioetan genotipoen informazio panel bat garatu zen eta eskuragarri dago SMARTER webgunean. Hazkuntzak ustiategietan eta populazio-mailan dituen eragin agroekologikoei buruzko ikerketen emaitzek frogatu zuten: aukera handiak daudela balioa sortzeko I+E ezaugarrien hobekuntza genetikoari esker; Abeltzainek argi ikusten dute animalien erresilientzia eta eraginkortasunaren beharra nekazaritza-sistema sendo eta etorkizunekoetan; eta ekoizpenaren eta I+G ezaugarrien artean nahi den hautapen-oreka lortzen duten hazkuntza-helburuak ezartzeko aukera dago.