H2020 PIGS Proiektua: Streptococcus suis-en aurkako prebentzio-programa global berritzailea.
- Mota Proiektua
- Egoera Bete
- Exekuzioa 2017 -2022
- Esleitutako Aurrekontua 4.998.103,75 €
- Eremua Europeo
- Finantza-iturri nagusia Horizonte 2020
- Proiektuaren webgunea Proyecto PIGSs
Streptococcus suis txerri-gaixotasun endemikoa da, eta galera ekonomiko handiak eragiten dizkio txerri-ekoizpen industriari txerriak eskala handian hazten diren herrialde guztietan. Herrialde batzuetan, S. suis da txerrikumeen hilkortasun eta morbiditate kausa nagusia, eta aminopenizilina antibiotikoak prebentzio neurri gisa errezetatzeko arrazoi ohikoena. S. suis gizakien patogeno zoonotikoa ere bada, eta mundu osoan jakinarazitako infekzioak nabarmen handitu dira azken urteotan. S. suis barruan mota asko daude (serotipoak, genotipoak, patotipoak), eta horiek arazoak sortzen dituzte mota guztiei zuzendutako kontrol-estrategiak garatzeko orduan. Txerri helduengan sintomarik gabeko garraiatze ohikoa da, eta, ostalariaren-patogeno-ingurumenaren arteko interakzioei buruzko ezagutza faltarekin batera, patogeno honen izaera endemikoa kontrolatzeko porrotaren arrazoi nagusia da.
Proiektuaren emaitzek S. suis infekzioetan ostalariaren-patogeno-ingurunea elkarrekintzen ulermenean eragina izango dute, txerri-ekoizle diren herrialde nagusietako eremu geografiko adierazgarrietako 1200-1500 S. suis isolaturen genoma sekuentziatuz eta gaixotasun inbaditzailearekin eta garraiatze asintomatikoarekin genoma osoko asoziazio-azterketak eginez. Infekzio arriskuaren jarraipen globalerako diagnostiko metodo berriak garatu eta probatuko dira ikerketa-ustiategietan. Ikerketa epidemiologikoek S. suis gaixotasun inbaditzailearen arrisku-faktoreak zehaztuko dituzte, koinfekzioen zeregina barne, eta lehen aldiz gaixotasunaren dinamika behar bezala ebaluatuko dute ustiategi adierazgarri batean. Patogenesian parte hartzen duten birulentzia-mekanismoen ulermena handituko dugu, S. suis-ek sistema immunitario jaiotzetikoarekin dituen elkarrekintzak barne. Proiektuaren emaitzek prebentzio eta kontrol estrategien ebidentzia-oinarria indartuko dute, txerto-antigeno kontserbatu berriak txerrietan probatuz eta mikrobiotaren manipulazioan eta sistema immunitarioaren estimulazioan eta heltzean oinarritutako prebentzio-estrategiak erabiliz.
PIGSs proiektuaren helburu nagusia txerrietan S. suis infekzioetan ostalariaren-patogeno-ingurunea elkarrekintzen ulermena handitzea da, horrela berrikuntza berrietarako eta prebentzio eta kontrol estrategia eraginkorretarako ebidentzia oinarria indartuz. Helburu orokor hau (goian aipatutakoa) proiektuaren iraupenean gauzatuko diren helburu espezifiko hauetan banatzen da:
- 1. helburua S. suis-en patogenesiaren ulermena handitzea da, patogenesian partzialki karakterizatutako edo karakterizatu gabeko birulentzia faktoreen eginkizuna karakterizatuz (WP1 eta WP2-k jasotzen dituzte).
- 2. helburua S. suis gaixotasun inbaditzailearen arriskua murrizteko eta hesteetako fisiologia laguntzeko irtenbide mikrobianoak aurkitzea da, txerriaren mikrobiotaren eta sistema immunitarioaren arteko elkarrekintza aztertuz eta S. suis-en arteko antagonismoa komentsal espezifikoek in vivo aztertuz (WP3-k jasotzen du).
- 3. helburua gripearen eta txerri ugalketa eta arnas sindromearen birusaren (PRRSV) koinfekzioak S. suis-ekin gaixotasunean eta esku-hartzearen porrotean nola eragiten duen argitzea da (WP4-k jasotzen du).
- 4. helburua S. suis-ek eragindako gaixotasun klinikoaren garapenean parte hartzen duten arrisku-faktore nagusiak (S. suis anduiaren birulentziaz gain) zehaztea eta gaixotasunak txerrikumeengan duen eragina zehaztea da (WP5-ek jasotzen duena).
- 5. helburua (1) S. suis-en gaixotasunak eragiten dituzten anduiak identifikatzeko diagnostiko-metodo berriak eta (2) S. suis-en hazkundea inhibitzen duten prebentzio-estrategiak identifikatzea eta garatzea da (WP3 eta WP6-k jasotzen dituzte).
- 6. helburua PIGS proiektuaren emaitzen eragin iraunkorra sustatzea eta zientzia aldetik alfabetatuagoa den gizarte bat lortzen laguntzea da, publikoaren parte-hartzearen eta PIGS ikerketa eta berrikuntzen komunikazioaren bidez, beren komunitatetik haratago (WP8-k jasotzen du).
Proiektuaren emaitzek S. suis infekzioetan ostalariaren-patogeno-ingurunea elkarrekintzen ulermenean eragina izango dute, txerri-ekoizle diren herrialde nagusietako eremu geografiko adierazgarrietatik datozen S. suis isolatuen bilduma handi bat sekuentziatuz eta gaixotasun inbaditzailearekin eta eramaile asintomatikoekin genoma osoko asoziazio-azterketak eginez. Infekzio arriskuaren jarraipen globalerako diagnostiko metodo berriak garatu dira eta ikerketa-ustiategietan probatu dira. Ikerketa epidemiologikoek S. suis gaixotasun inbaditzailearen arrisku-faktoreak zehaztu dituzte, koinfekzioen zeregina barne, eta lehen aldiz gaixotasunaren dinamika behar bezala ebaluatu dute ustiategi adierazgarri batean. Patogenesian parte hartzen duten birulentzia-mekanismoen ulermena ere hobetu dugu, S. suis-ek sistema immunitario jaiotzetikoarekin dituen elkarrekintzak barne.
Proiektuaren emaitzek prebentzio eta kontrol estrategien ebidentzia-oinarria indartu dute, txertoen antigeno kontserbatu berriak txerriengan probatuz eta mikrobiotaren manipulazioan eta sistema immunitario jaiotzetikoaren estimulazioan eta heltzean oinarritutako prebentzio-estrategiak ezarriz. 3. proiektu-aldian, lan-pakete guztiek aurrera jarraitu zuten eta zeregin guztiak burutu ziren, COVID-19 pandemiak eragindako atzerapen handiak izan arren.
PIGSek (Streptococcus suis Berritzaile Globalaren Prebentziorako Programa) jorratzen dituen gaiak mundu mailako txerri-ekoizpen industriak jasaten dituen galera ekonomiko handiak eta Streptococcus suis bakterioaren infekzioek animalien osasunean eragiten duten zama dira. Patogeno honek gaixotasun inbaditzailea sor dezake txerrietan, eta sarritan agertzen dira sepsis akutua, meningitisa, endokarditisa, pneumonia eta artritisa bezalako sintomak. Munduko txerri-ustiategien ia % 100ek animalia eramaileak dituzte. S. suis-ek txerrietan gaixotasunak eragiten dituen ala ez faktore patogenoen, ostalariaren faktoreen, ingurumen-faktoreen eta haien arteko elkarrekintzen araberakoa da. Mikrobio patogenoaren osaera genetikoaren eta ostalariaren suszeptibilitatearen araberakoa da, eta horretan eragina izan dezakete koinfekzioak, adinak, immunitateak, mikrobiotak eta abarrek. Gainera, ingurumen-faktoreek, hala nola estresak eta higiene faktoreek, elkarrekintzan eragina izan dezakete ostalaria, mikrobiota edo patogenoaren "portaera" (egoera neutro edo birulento komentsalari erreferentzia eginez) aldatuz.
Ezagutza hau txertoen bidez gaixotasunak prebenitzeko berrikuntzak garatzeko, S. suis kolonizazioarekiko erresistentzia sustatuz eta txerrikumeen immunitate naturala estimulatuz erabiliko da. Gainera, sortutako ezagutzak andui patogenoen markatzaile diagnostikoak garatzera eramango du, eta horrek, lehen aldiz, ustiategietako infekzioen dinamika aztertzea eta abeltzaintzako praktiketako arrisku-faktoreak identifikatzea ahalbidetuko du, baita gaixotasunen agerraldiak prebenitzeko edo kontrolatzeko estrategiak ere. PIGSs proiektuaren helburu nagusietako bat txerrietan S. suis infekzioetan ostalariaren-patogeno-ingurunea elkarrekintzen ulermena sakontzea da, horrela berrikuntza berrietarako eta prebentzio eta kontrol estrategia eraginkorretarako ebidentzia oinarria indartuz.
Streptococcus suis txerri-gaixotasun endemikoa da, eta galera ekonomiko handiak eragiten dizkio txerri-ekoizpen industriari txerriak eskala handian hazten diren herrialde guztietan. Herrialde batzuetan, S. suis da txerrikumeen hilkortasun eta morbiditate kausa nagusia, eta aminopenizilina antibiotikoak prebentzio neurri gisa errezetatzeko arrazoi ohikoena. S. suis gizakien patogeno zoonotikoa ere bada, eta mundu osoan jakinarazitako infekzioak nabarmen handitu dira azken urteotan. S. suis barruan mota asko daude (serotipoak, genotipoak, patotipoak), eta horiek arazoak sortzen dituzte mota guztiei zuzendutako kontrol-estrategiak garatzeko orduan.
Txerri helduengan sintomarik gabeko garraiatze ohikoa da, eta, ostalariaren-patogeno-ingurumenaren arteko interakzioei buruzko ezagutza faltarekin batera, patogeno honen izaera endemikoa kontrolatu gabe egotearen arrazoi nagusia da. Proiektuaren emaitzek S. suis infekzioetan ostalariaren-patogeno-ingurunea elkarrekintzen ulermenean eragina izango dute, txerri-ekoizle diren herrialde nagusietako eremu geografiko adierazgarrietatik datozen 1200-1500 S. suis isolatuen genomaren sekuentziazioaren eta gaixotasun inbaditzailearekin eta eramate asintomatikoarekin genoma osoko asoziazio-azterketen bidez.
Infekzio arriskuaren jarraipen globalerako diagnostiko metodo berriak garatuko dira, eta kasuen ustiategietan probatuko dira. Ikerketa epidemiologikoek S. suis gaixotasun inbaditzailearen arrisku-faktoreak zehaztuko dituzte, koinfekzioen zeregina barne, eta lehen aldiz gaixotasunaren dinamika behar bezala ebaluatuko dute ustiategi adierazgarri batean. Patogenesian parte hartzen duten birulentzia-mekanismoen ulermena handituko dugu, S. suis-ek sistema immunitario jaiotzetikoarekin dituen elkarrekintzak barne. Proiektuaren emaitzek prebentzio eta kontrol estrategien oinarri enpirikoa indartuko dute, txertoen antigeno kontserbatu berriak txerrietan probatuz eta mikrobiotaren manipulazioan eta sistema immunitario jaiotzetikoaren estimulazioan eta heltzean oinarritutako prebentzio estrategien bidez.
Munduko ia txerri-ustiategi guztiek Streptococcus suis-en andui patogenoak dituzte, eta hauek gizakiak ere kutsa ditzakete. Behar-beharrezko zaintza eta prebentzio tresnak garatzen ari dira. Streptococcus suis (S. suis) bakterio patogeno bat da, eta txerrikumeengan sepsis akutua, meningitisa, endokarditisa eta pneumonia bezalako baldintzak eragiten ditu. Txerrien arnas sindrome konplexuarekin ere lotzen da maiz, txerrien hilkortasunaren kausa nagusietako bat. Gainera, COVID-19 eragiten duen arnas sindrome akutu larriaren 2. koronabirusak (SARS-CoV-2) bezala, S. suis zoonotikoa da, animalietatik gizakietara transmititu daitezkeen patogeno askoren artean bat. EBk finantzatutako PIGSs proiektuak S. suis-en patogenizitateari buruzko gure ulermena hobetzen ari da, eta, horri esker, funtsezko txertoak eta zaintza-tresnak garatu ahal izango dira. Streptococcus suis eta antibiotikoaren enigma S. suis patogenoaren infekzio-agerraldiak oso ohikoak dira. Txerrien ikerketek erakutsi zuten Europako ustiategi kaltetuetako animalien % 3,3 eta % 4 artean S. suis gaixotasun inbaditzailea zutela. Honek milioika kostatzen dio industriari, gizakien gaixotasunen kostu ekonomikoak ahaztu gabe. Hego-ekialdeko Asian egindako ikerketa batek, kasu gehien dauden tokian, jakinarazi du gizakien gaixotasunen kostu ekonomikoak milioika eurokoak direla urtero, osasun-laguntzaren kostu zuzen eta zeharkakoengatik eta produktibitate-galeragatik. Gaur egun arte, ez dago Europan baimendutako babes gurutzatuko txertorik. Jerry Wellsek, Herbehereetako Wageningen Unibertsitateko eta Ikerketako proiektuaren koordinatzaileak, dioenez, "zaintza-metodo eta txerto eraginkorren faltak prebentzio desegokia eta antibiotikoen erabilera zabala ekarri ditu mundu osoan".
Horrek antibiotikoekiko erresistentzia handitzea dakar, eta erresistentzia hori animaliak eta gizakiak infektatzen dituzten beste patogeno batzuetara hedatu daiteke, eta gizakien kontsumorako elikagaietan antibiotikoen presentzia handitzea. Polimerasaren kate-erreakzioa eta bioinformatika tresnak aprobetxatzea S. suis gaixotasunaren mekanismoak argitzea erronka bat da. Andui batzuen azpimultzo bat bakarrik dago lotuta morbiditate eta hilkortasun larria eragiten duten gaixotasunekin. 2.000 andui patogeno eta ez-patogeno inguruko bilduma global bat erabiliz, PIGS-ek andui patogenoetan oso kontserbatuta zeuden baina gainerakoetan ez zeuden geneak identifikatu zituen.
Markatzaile hauek erabili ziren polimerasa-kate-erreakzio (PCR) kuantitatiboak garatzeko, DNA zati txikiak milioika kopiatan azkar anplifikatzen dituztenak. «PCR analisiak erabil daitezke ustiategietako patogeno isolatuen zaintzarako», azaldu du Wellsek. Horrek prebentzio eta tratamendu estrategiak ere ahalbidetuko ditu, adibidez, andui patogenoak beren ondorengoei transmititzen dizkieten zerrameentzat. Azkenik, taldeak bioinformatika tresnak erabili zituen antigeno kontserbatuak (S. suis andui patogeno guztietan kontserbatutako proteina sekuentziak) detektatzeko eta txerrietan antigorputz babes-erantzunak lortzeko. Taldea une honetan ebaluatzen ari da erantzun hori nola hobetu eta etorkizuneko entseguetan txerto hauek eragindako babesa ebaluatzeko analisiak garatzen.
Mekanismoak, arrisku-faktoreak eta txertoak PIGS proiektua amaitzear egon daiteke, baina informazio askoz gehiago espero da egiten ari diren esperimentu eta analisietatik. Taldea andui patogenoen biziraupen- edo transmisio-mekanismoak argitzen ari da gaur egun. Horrez gain, Wellsek adierazi duenez, "azterketa epidemiologiko handi bat martxan dago oraindik, eta horri esker, ustiategi desberdinetan S. suis gaixotasuna hartzeko arriskua areagotzen duten faktoreei buruzko informazio gehiago lortuko dugu. Txerrikumeetan egiten ari garen txerto-proba iraultzailea izan daiteke, txerrikume gazteentzako txertaketa-estrategia berriak agerian utziz. PIGSek nabarmen hobetu dute S. suis-en ostalariaren, patogenoaren eta ingurunearen arteko elkarrekintzen ulermena. Horrek txerto eta kontrol-estrategia eraginkorragoak garatzen lagunduko du, baita ustiategiko zaintza eskala handian ere, gaixotasuna murrizteko edo ezabatzeko".
Txerri-taldeetan S. suis-en kontrola oztopatzen da, oro har, serotipo eta andui anitzen aurka babesten duten txertoen faltagatik. Hau anduien artean, serotipoen artean eta haien barruan dagoen genotipiko, fenotipiko eta geografiko aldakortasun handiagatik da. Gure anbizioetako bat proteina azpiunitateen txerto gurutzatu babesle global bat garatzea da, GWAS erabiliz patogeno isolatuetan kontserbatzen diren antigeno hautagai batzuk hautatzeko. GWAS eta alderantzizko txerto-teknologia konbinatzen dituen ikuspegi berritzaile hau munduko txerri-ekoizpen eskualde nagusietako isolatuen bilduma global handi bat sekuentziatzeko dugun anbizioari esker bakarrik izango da posible.
Bigarren helburua S. suis andui patogenoen diagnostikoan berrikuntzak garatzea da, GWAS-en oinarrituta. Jatorrizko ideia honek andui birulento patogenoak eta andui ez-birulentoak bereizteko ezintasuna gaindituko du. Arazo honi konpontzeak, lehen aldiz, diagnostikoak erabiltzea ahalbidetuko du antibiotikoen metafilaxia eta txertoa gidatzeko S. suis agerraldiak kontrolatzeko.
Horrek eraginkortasuna handitzen du eta txerri-hazkuntzan antibiotikoen erabilera murrizten laguntzen du. Epe luzera, PIGSs proiektuak txerriengan S. suis gaixotasuna nabarmen murrizten laguntzea espero du, eta, ondorioz, animalien osasuna eta ongizatea hobetzen.
- WAGENINGEN UNIVERSITY (WU)
Lotutako proiektuak
