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Proyecto H2020 FOUNDATION:Base mediada por Fusarium oxysporum de la modulación específica del tipo de célula en la interacción con múltiples huéspedes

  • Type Project
  • Status Completado
  • Execution 2018 -2020
  • Assigned Budget 170.121,6 €
  • Scope Europeo
  • Main source of financing H2020
  • Project website BARBARA
Description
Los hongos patógenos tienen un impacto drástico en la nutrición humana al reducir la productividad de los cultivos. Muchas interacciones entre hongos y plantas ocurren en el suelo y afectan crucialmente la salud de las plantas. Se sabe muy poco sobre cómo los patógenos transmitidos por el suelo infectan las raíces y afectan la inmunidad del huésped. Un grupo particularmente destructivo de hongos que infectan las raíces causa marchitez vascular, que ataca a muchos cultivos, coloniza las raíces y causa un marchitamiento progresivo. Estas enfermedades se encuentran entre las más difíciles de controlar, ya que los patógenos suelen ser inaccesibles a los productos químicos presentes en las raíces. Por lo tanto, se controlan con compuestos inespecíficos para fumigación que tienen un efecto perjudicial. Para generar una solución sostenible contra estos hongos, es crucial comprender a fondo cómo estos patógenos establecen compatibilidad con diversos huéspedes y los procesos vegetales a los que se dirigen. El género de hongos Fusarium contiene muchos patógenos transmitidos por el suelo que causan enfermedades de marchitez en numerosos cultivos. Actualmente, existe poca información sobre la crucial etapa de infección biotrófica (fase vital) de Fusarium. El hongo penetra en las raíces y finalmente coloniza el xilema, lo que provoca la muerte o la ausencia de muerte, e incluso estilos de vida endófitos. Por lo tanto, Fusarium es un excelente modelo para investigar la compatibilidad multihuésped y la inmunosupresión. Controlar los fitopatógenos transmitidos por el suelo es muy difícil debido a su alta persistencia y su notable capacidad de adaptación a la planta huésped y al medio ambiente. Dado que la mayoría de los fungicidas para el suelo están prohibidos por la legislación de la UE, existe una necesidad urgente de desarrollar nuevas estrategias de control que sean eficientes, duraderas y respetuosas con el medio ambiente. Identificar los eventos moleculares que sustentan el desarrollo de enfermedades en diversos huéspedes resuelve la antigua pregunta de cómo estos hongos perciben el sistema vascular del huésped. Esto es de fundamental interés en las interacciones microbianas. El objetivo general de mi propuesta es comprender los mecanismos que subyacen a la colonización de plantas por F. oxysporum para conquistar un amplio rango de huéspedes. Mi hipótesis es que la alteración del espacio intercelular (apoplasto) donde reside principalmente el patógeno durante las etapas biotróficas en el huésped/no huésped servirá como sitio de acción de los determinantes de patogenicidad “centrales” para colonizar un amplio espectro de cultivos agronómicamente importantes.
Description of activities
Dado que F. oxysporum crece principalmente intercelularmente durante las primeras etapas, planteamos la hipótesis de que el patógeno podría secretar proteínas de patogenicidad, conocidas como efectores, en este espacio intercelular para determinar la compatibilidad general y gestionar la inmunidad del hospedador. Como parte de mi beca MSCA, establecí principalmente el aislamiento de fluido apoplástico de raíces de tomate infectadas y utilicé la proteómica de descubrimiento para identificar efectores. Estos "efectores apoplásticos centrales" identificados codifican para proteínas hipotéticas pequeñas, secretadas y ricas en cisteína, que se conservan en todo el complejo de especies de Fusarium (Redkar et al., en prep.). Estos efectores centrales, denominados (ERC: Efector para la Compatibilidad Radicular ERC1-3), se inducen in planta tras la colonización del hospedador/no hospedador y contribuyen a la virulencia. También realicé un análisis exhaustivo de ARN-Seq durante las primeras etapas de la colonización por F. oxysporum y descubrí que una proporción importante del secretoma codifica principalmente para efectores que se conservan en todo el complejo específico de Fusarium. Esto sugiere que Fusarium depende de un repertorio conservado de efectores para establecer la compatibilidad en hospedadores y no hospedadores, y luego los determinantes específicos del hospedador pueden desempeñar principalmente un papel en determinar el marchitamiento, que es específico del hospedador. También investigamos la naturaleza del proteoma radicular intercelular activo durante la colonización por Fusarium y cómo su actividad desencadena la señalización de defensa. El fluido apoplástico infectado se utilizó para el Perfilado de Proteínas Basado en la Actividad (ABPP), que indicó que Fusarium es capaz de suprimir diferentes clases de proteasas. Con base en estos hallazgos y nuestro interés en la inmunidad apoplástica, lidero un artículo de investigación destacado en Trends in Plant Science (doi.org/10.1016/j.tplants.2019.06.009). El artículo destaca el trabajo sobre el efector de Ustilago maydis Pit2, que tiene un dominio inhibidor de proteasas y que imita el sustrato de la proteasa. Además, fui coautor de una revisión sobre el conocimiento actual de las interacciones moleculares de los hongos del carbón y sus hospedadores en Annual Reviews (doi: 10.1146/annurev-phyto-082718-100139). Esto ha influido en la investigación en curso en el ámbito de la interacción planta-patógeno. Además, he utilizado el patosistema Arabidopsis-Fusarium para comprender las señales derivadas del huésped que el hongo detecta al alcanzar el xilema. La endodermis de la raíz es una capa celular protectora que separa la zona cortical y la vasculatura. El espacio entre las células endodérmicas se impregna con un polímero hidrofóbico a base de lignina, denominado banda de Casparian (CS), y actúa como una barrera selectiva. Las proteínas de membrana asociadas a la pared celular (CASP) se fusionan para formar una banda continua que es guiada por la bien definida vía Schengen (SGN). Mi hipótesis es que las marchiteces vasculares probablemente interfieren con diferentes componentes de la vía SGN para detectar la vasculatura. Utilizamos una colección de mutantes de Arabidopsis en la vía SGN, que muestran diversos grados de fenotipo de patogenicidad con F. oxysporum Fo5176. Por lo tanto, la vía CS parece estar involucrada en guiar a Fusarium hacia la vasculatura. Los resultados de mi proyecto se presentaron en seminarios de investigación en la Conferencia de Becarios CEPLAS de la Universidad de Düsseldorf (Alemania) y del IISER (Pune, India). En adelante, continuaré en mi laboratorio anfitrión gracias a la beca Juan de la Cierva. Estoy trabajando en la caracterización funcional de los efectores CORE identificados en Fusarium. También exploraré las interesantes pistas sobre la interferencia de Fusarium con la vía de la Franja de Casparian en la detección de la vasculatura. Al finalizar, mi objetivo es publicar dos artículos de investigación que detallen mis hallazgos. Además del trabajo propuesto, también fui el autor correspondiente de dos artículos de comentario: uno que describe cómo los patógenos de la raíz han evolucionado para dirigirse a los reguladores transcripcionales maestros de la vía del ácido salicílico (doi: 10.1098/rstb.2015.0459) y otro que ofrece una visión general de cómo los patógenos han evolucionado para utilizar proteínas transportadoras para funciones de virulencia (doi: 10.1111/nph.14137).
Objectives
Los hongos tienen un impacto devastador en la nutrición y la salud humana. Cada año, los hongos patógenos provocan enormes pérdidas agrícolas en las plantas de cultivo y contaminan los alimentos con micotoxinas nocivas. El hongo patógeno transmitido por el suelo, Fusarium oxysporum, infecta las raíces de las plantas y el tejido vascular, provocando enfermedades de marchitez en más de cien cultivos diferentes, incluidas dicotiledóneas y monocotiledóneas. Una cepa particularmente agresiva de este patógeno, la raza tropical 4, está amenazando las plantaciones de banano en todo el mundo. Actualmente, hay poca información sobre la etapa crucial de la infección biotrófica de los patógenos vasculares, desde la penetración de la raíz hasta la colonización de los vasos del xilema. Fusarium proporciona un modelo excelente para investigar la detección, adaptación y supresión de la inmunidad de las plantas específicas de las células relacionadas con las primeras etapas de la infección. El grupo huésped informó recientemente sobre el mecanismo de detección quimiotrófico utilizado por este patógeno e identificó las señales de la planta huésped percibidas por Fusarium en el suelo. Además, su trabajo reveló una acción combinada de enzimas implicadas en la remodelación de la pared celular de los hongos y la degradación de la pared celular de las plantas, lo que contribuye a la virulencia de este patógeno. En este proyecto, nuestro objetivo es identificar los genes de virulencia específicos de células que F. oxysporum utiliza para colonizar un huésped dicotiledóneo (Arabidopsis) versus monocotiledónea (Banana) que tiene una arquitectura de tejido vascular fundamentalmente distinta. Usaremos RNA-Seq dual junto con microdisección por captura láser (LCM) para identificar componentes centrales de compatibilidad tanto en el patógeno como en la planta, que son esenciales para establecer la enfermedad de marchitez. Esto conducirá a la identificación y caracterización de objetivos potenciales en esta interacción que podrían usarse para desarrollar nuevas estrategias de resistencia en los esfuerzos en curso de mejoramiento del banano. Por lo tanto, este proyecto avanzará en el conocimiento fundamental de cómo un hongo detecta y coloniza una gama tan amplia de huéspedes, al tiempo que creará nuevas oportunidades para la protección de cultivos al diseccionar la interacción con una resolución específica de tipo celular.
Results
Los hallazgos de mi proyecto MSCA han generado nuevos conocimientos sobre las estrategias de colonización de los patógenos radiculares. La identificación de efectores conservados en Fusarium que probablemente median la compatibilidad nos permitirá comprender mejor los mecanismos moleculares que subyacen a la necesidad de una fase biotrófica corta en el ciclo de vida de los patógenos. Además, la identificación de los procesos apoplásticos de las plantas que patógenos como Fusarium manipulan proporcionará nuevas vías para comprender la interacción molecular y contribuirá al desarrollo de resistencia. En general, creo que los resultados de mi proyecto tendrán amplias implicaciones, ya que ofrecen una primera visión de las cruciales fases de infección asintomática de estos importantes patógenos fúngicos. Asimismo, al promover mi investigación a través de artículos generales e interacción con los alumnos de la escuela por Skype a Scientist, he podido llegar a un público general. Esto me ha proporcionado una excelente plataforma para promocionar mi trabajo y dar a conocer mi investigación al público. Asimismo, mi participación en congresos me ha permitido ampliar mi red profesional, aumentando mis oportunidades de convertirme en un investigador principal exitoso.
Coordinators
  • UNIVERSIDAD DE CORDOBA (UCO)
Collaborators
  • BEOGRADSKE ELEKTRANE (BEOGRADSKE ELEKTRANE)
  • CAVERION SUOMI OY (CAVERION)
  • SOLINTEL M & P SL (SOLINTEL)
  • NEDERLANDSE ORGANISATIE VOOR TOEGEPAST NATUURWETENSCHAPPELIJK ONDERZOEK TNO (NETHERLANDS ORGANISATION FORAPPLIED SCIENTIFIC RESEARCH)
  • KIWI POWER LTD
  • ASM RESEARCH SOLUTIONS STRATEGY SPOLKA Z OGRANICZONA ODPOWIEDZIALNOSCIA
  • HYPERTECH (CHAIPERTEK) ANONYMOS VIOMICHANIKI EMPORIKI ETAIREIA PLIROFORIKIS KAI NEON TECHNOLOGION (HYPERTECH AE)
  • ETRA INVESTIGACION Y DESARROLLO SA
  • METLEN ENERGY & METALS AE (METLEN)
  • PREDUZECE ZA INFORMACIONE TEHNOLOGIJE I ELEKTRONSKO TRGOVANJE BELIT DOO (BELIT DOO BEOGRAD IT AND E-COMMERCE COMPANY)
  • HONEYWELL, SPOL. S.R.O (HONEYWELL)
  • KONCAR - INZENJERING DOO ZA PROIZVODNJU I USLUGE (KONCAR - ENGINEERING CO LTD FOR PRODUCTION AND SERVICES)